RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421540.1

NFS1-207, Transcript of NFS1, cysteine desulfurase, humanhuman

TSL 5

Gene NFS1, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFS1-207ENST00000421540 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.07■■■■■ 5.29
NFS1-207ENST00000421540 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.78■■■■■ 4.44
NFS1-207ENST00000421540 ABCC9O60706 1549 aa42.37■■■■■ 4.37
NFS1-207ENST00000421540 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.57■■■■■ 4.09
NFS1-207ENST00000421540 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.55■■■■■ 4.08
NFS1-207ENST00000421540 NACADO15069 1562 aa40.43■■■■■ 4.06
NFS1-207ENST00000421540 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.05■■■■■ 4
NFS1-207ENST00000421540 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
NFS1-207ENST00000421540 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.73■■■■□ 3.95
NFS1-207ENST00000421540 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.62■■■■□ 3.93
NFS1-207ENST00000421540 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.39■■■■□ 3.9
NFS1-207ENST00000421540 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.25■■■■□ 3.87
NFS1-207ENST00000421540 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.24■■■■□ 3.87
NFS1-207ENST00000421540 SCRIBQ14160 1630 aa39.07■■■■□ 3.84
NFS1-207ENST00000421540 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.89■■■■□ 3.82
NFS1-207ENST00000421540 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
NFS1-207ENST00000421540 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.23■■■■□ 3.71
NFS1-207ENST00000421540 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.13■■■■□ 3.69
NFS1-207ENST00000421540 NCAPD3P42695 1498 aa37.35■■■■□ 3.57
NFS1-207ENST00000421540 SMARCA4P51532 1647 aa37.32■■■■□ 3.56
NFS1-207ENST00000421540 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.29■■■■□ 3.56
NFS1-207ENST00000421540 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
NFS1-207ENST00000421540 SMARCA2P51531 1590 aa37.22■■■■□ 3.55
NFS1-207ENST00000421540 HMGXB3Q12766 1538 aa37.05■■■■□ 3.52
NFS1-207ENST00000421540 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.02■■■■□ 3.52
NFS1-207ENST00000421540 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
NFS1-207ENST00000421540 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.95■■■■□ 3.51
NFS1-207ENST00000421540 ERCC6Q03468 1493 aa36.61■■■■□ 3.45
NFS1-207ENST00000421540 WIZO95785 1651 aa36.54■■■■□ 3.44
NFS1-207ENST00000421540 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
NFS1-207ENST00000421540 NESP48681 1621 aa36.51■■■■□ 3.43
NFS1-207ENST00000421540 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.36■■■■□ 3.41
NFS1-207ENST00000421540 CUX2O14529 1486 aa36.29■■■■□ 3.4
NFS1-207ENST00000421540 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.28■■■■□ 3.4
NFS1-207ENST00000421540 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.25■■■■□ 3.39
NFS1-207ENST00000421540 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
NFS1-207ENST00000421540 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.94■■■■□ 3.34
NFS1-207ENST00000421540 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
NFS1-207ENST00000421540 CFTRP13569 1480 aa35.93■■■■□ 3.34
NFS1-207ENST00000421540 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.83■■■■□ 3.33
NFS1-207ENST00000421540 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.82■■■■□ 3.32
NFS1-207ENST00000421540 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.82■■■■□ 3.32
NFS1-207ENST00000421540 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.81■■■■□ 3.32
NFS1-207ENST00000421540 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.71■■■■□ 3.31
NFS1-207ENST00000421540 WDR62O43379 1518 aa35.66■■■■□ 3.3
NFS1-207ENST00000421540 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
NFS1-207ENST00000421540 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
NFS1-207ENST00000421540 PRDM2Q13029 1718 aa35.4■■■■□ 3.26
NFS1-207ENST00000421540 ABCC8Q09428 1581 aa35.22■■■■□ 3.23
NFS1-207ENST00000421540 TOPBP1Q92547 1522 aa35.17■■■■□ 3.22
NFS1-207ENST00000421540 IFT140Q96RY7 1462 aa35.09■■■■□ 3.21
NFS1-207ENST00000421540 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.08■■■■□ 3.21
NFS1-207ENST00000421540 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
NFS1-207ENST00000421540 OSCARQ8IYS5 282 aa34.88■■■■□ 3.17
NFS1-207ENST00000421540 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
NFS1-207ENST00000421540 SOGA1O94964 1423 aa34.8■■■■□ 3.16
NFS1-207ENST00000421540 CUX1P39880 1505 aa34.74■■■■□ 3.15
NFS1-207ENST00000421540 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
NFS1-207ENST00000421540 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.73■■■■□ 3.15
NFS1-207ENST00000421540 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.72■■■■□ 3.153e-6■■■□□ 15.6
NFS1-207ENST00000421540 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.72■■■■□ 3.15
NFS1-207ENST00000421540 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
NFS1-207ENST00000421540 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
NFS1-207ENST00000421540 FBLN2P98095 1184 aa34.53■■■■□ 3.12
NFS1-207ENST00000421540 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.11
NFS1-207ENST00000421540 WDR97A6NE52 1622 aa34.48■■■■□ 3.11
NFS1-207ENST00000421540 TRIM41Q8WV44 630 aa34.42■■■■□ 3.1
NFS1-207ENST00000421540 GRIN2BQ13224 1484 aa34.39■■■■□ 3.1
NFS1-207ENST00000421540 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.37■■■■□ 3.09
NFS1-207ENST00000421540 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
NFS1-207ENST00000421540 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.36■■■■□ 3.09
NFS1-207ENST00000421540 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.35■■■■□ 3.09
NFS1-207ENST00000421540 TOP2BQ02880 1626 aa34.33■■■■□ 3.09
NFS1-207ENST00000421540 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
NFS1-207ENST00000421540 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.28■■■■□ 3.08
NFS1-207ENST00000421540 SYNJ1O43426 1573 aa34.28■■■■□ 3.08
NFS1-207ENST00000421540 CHD1O14646 1710 aa34.26■■■■□ 3.07
NFS1-207ENST00000421540 SYNJ2O15056 1496 aa34.2■■■■□ 3.07
NFS1-207ENST00000421540 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.16■■■■□ 3.06
NFS1-207ENST00000421540 ARHGEF11O15085 1522 aa34.13■■■■□ 3.05
NFS1-207ENST00000421540 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.12■■■■□ 3.05
NFS1-207ENST00000421540 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.12■■■■□ 3.05
NFS1-207ENST00000421540 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.12■■■■□ 3.05
NFS1-207ENST00000421540 PBRM1Q86U86 1689 aa34.11■■■■□ 3.05
NFS1-207ENST00000421540 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.01■■■■□ 3.03
NFS1-207ENST00000421540 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.96■■■■□ 3.03
NFS1-207ENST00000421540 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.95■■■■□ 3.03
NFS1-207ENST00000421540 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.95■■■■□ 3.03
NFS1-207ENST00000421540 GRIN2AQ12879 1464 aa33.91■■■■□ 3.02
NFS1-207ENST00000421540 ADAMTS12P58397 1594 aa33.88■■■■□ 3.01
NFS1-207ENST00000421540 ARAP1Q96P48 1450 aa33.82■■■■□ 3.01
NFS1-207ENST00000421540 KIF27Q86VH2 1401 aa33.82■■■■□ 3
NFS1-207ENST00000421540 NUP160Q12769 1436 aa33.78■■■■□ 3
NFS1-207ENST00000421540 IGF1RP08069 1367 aa33.72■■■□□ 2.99
NFS1-207ENST00000421540 CEP170Q5SW79 1584 aa33.68■■■□□ 2.98
NFS1-207ENST00000421540 JPH4Q96JJ6 628 aa33.57■■■□□ 2.96
NFS1-207ENST00000421540 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.54■■■□□ 2.96
NFS1-207ENST00000421540 CUL7Q14999 1698 aa33.51■■■□□ 2.95
NFS1-207ENST00000421540 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
NFS1-207ENST00000421540 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
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