RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456462.5

NFS1-209, Transcript of NFS1, cysteine desulfurase, humanhuman

TSL 5

Gene NFS1, Length 747 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFS1-209ENST00000456462 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.74■■■■■ 5.39
NFS1-209ENST00000456462 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.58■■■■■ 4.57
NFS1-209ENST00000456462 ABCC9O60706 1549 aa43.18■■■■■ 4.5
NFS1-209ENST00000456462 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.34■■■■■ 4.21
NFS1-209ENST00000456462 NACADO15069 1562 aa41.16■■■■■ 4.18
NFS1-209ENST00000456462 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.04■■■■■ 4.16
NFS1-209ENST00000456462 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.75■■■■■ 4.11
NFS1-209ENST00000456462 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
NFS1-209ENST00000456462 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.34■■■■■ 4.05
NFS1-209ENST00000456462 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.27■■■■■ 4.04
NFS1-209ENST00000456462 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.22■■■■■ 4.03
NFS1-209ENST00000456462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.09■■■■■ 4.01
NFS1-209ENST00000456462 BICRAQ9NZM4 1560 aa40■■■■□ 3.99
NFS1-209ENST00000456462 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.7■■■■□ 3.95
NFS1-209ENST00000456462 SCRIBQ14160 1630 aa39.69■■■■□ 3.94
NFS1-209ENST00000456462 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
NFS1-209ENST00000456462 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.02■■■■□ 3.84
NFS1-209ENST00000456462 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.91■■■■□ 3.82
NFS1-209ENST00000456462 NCAPD3P42695 1498 aa37.97■■■■□ 3.67
NFS1-209ENST00000456462 SMARCA4P51532 1647 aa37.92■■■■□ 3.66
NFS1-209ENST00000456462 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.89■■■■□ 3.66
NFS1-209ENST00000456462 SMARCA2P51531 1590 aa37.87■■■■□ 3.65
NFS1-209ENST00000456462 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
NFS1-209ENST00000456462 HMGXB3Q12766 1538 aa37.73■■■■□ 3.63
NFS1-209ENST00000456462 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
NFS1-209ENST00000456462 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.58■■■■□ 3.61
NFS1-209ENST00000456462 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.51■■■■□ 3.6
NFS1-209ENST00000456462 ERCC6Q03468 1493 aa37.36■■■■□ 3.57
NFS1-209ENST00000456462 NESP48681 1621 aa37.16■■■■□ 3.54
NFS1-209ENST00000456462 CUX2O14529 1486 aa37.15■■■■□ 3.54
NFS1-209ENST00000456462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.07■■■■□ 3.52
NFS1-209ENST00000456462 WIZO95785 1651 aa37.05■■■■□ 3.52
NFS1-209ENST00000456462 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
NFS1-209ENST00000456462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.9■■■■□ 3.5
NFS1-209ENST00000456462 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.86■■■■□ 3.49
NFS1-209ENST00000456462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
NFS1-209ENST00000456462 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
NFS1-209ENST00000456462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.67■■■■□ 3.46
NFS1-209ENST00000456462 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.66■■■■□ 3.46
NFS1-209ENST00000456462 CFTRP13569 1480 aa36.5■■■■□ 3.43
NFS1-209ENST00000456462 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.5■■■■□ 3.43
NFS1-209ENST00000456462 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.44■■■■□ 3.42
NFS1-209ENST00000456462 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.42■■■■□ 3.42
NFS1-209ENST00000456462 WDR62O43379 1518 aa36.37■■■■□ 3.41
NFS1-209ENST00000456462 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.25■■■■□ 3.39
NFS1-209ENST00000456462 PRDM2Q13029 1718 aa36.08■■■■□ 3.37
NFS1-209ENST00000456462 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
NFS1-209ENST00000456462 ABCC8Q09428 1581 aa35.81■■■■□ 3.32
NFS1-209ENST00000456462 TOPBP1Q92547 1522 aa35.75■■■■□ 3.31
NFS1-209ENST00000456462 IFT140Q96RY7 1462 aa35.72■■■■□ 3.31
NFS1-209ENST00000456462 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.67■■■■□ 3.3
NFS1-209ENST00000456462 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
NFS1-209ENST00000456462 OSCARQ8IYS5 282 aa35.55■■■■□ 3.28
NFS1-209ENST00000456462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
NFS1-209ENST00000456462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
NFS1-209ENST00000456462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
NFS1-209ENST00000456462 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
NFS1-209ENST00000456462 SOGA1O94964 1423 aa35.3■■■■□ 3.24
NFS1-209ENST00000456462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.28■■■■□ 3.243e-6■■■□□ 15.6
NFS1-209ENST00000456462 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.23■■■■□ 3.23
NFS1-209ENST00000456462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.23■■■■□ 3.23
NFS1-209ENST00000456462 CUX1P39880 1505 aa35.23■■■■□ 3.23
NFS1-209ENST00000456462 TRIM41Q8WV44 630 aa35.21■■■■□ 3.23
NFS1-209ENST00000456462 WDR97A6NE52 1622 aa35.15■■■■□ 3.22
NFS1-209ENST00000456462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
NFS1-209ENST00000456462 FBLN2P98095 1184 aa35.05■■■■□ 3.2
NFS1-209ENST00000456462 CHD1O14646 1710 aa34.98■■■■□ 3.19
NFS1-209ENST00000456462 GRIN2BQ13224 1484 aa34.97■■■■□ 3.19
NFS1-209ENST00000456462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.95■■■■□ 3.19
NFS1-209ENST00000456462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.93■■■■□ 3.18
NFS1-209ENST00000456462 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.92■■■■□ 3.18
NFS1-209ENST00000456462 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.92■■■■□ 3.18
NFS1-209ENST00000456462 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.92■■■■□ 3.18
NFS1-209ENST00000456462 ARHGEF11O15085 1522 aa34.89■■■■□ 3.18
NFS1-209ENST00000456462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.89■■■■□ 3.18
NFS1-209ENST00000456462 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.89■■■■□ 3.18
NFS1-209ENST00000456462 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
NFS1-209ENST00000456462 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.87■■■■□ 3.17
NFS1-209ENST00000456462 TOP2BQ02880 1626 aa34.81■■■■□ 3.16
NFS1-209ENST00000456462 SYNJ2O15056 1496 aa34.79■■■■□ 3.16
NFS1-209ENST00000456462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.78■■■■□ 3.16
NFS1-209ENST00000456462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.75■■■■□ 3.15
NFS1-209ENST00000456462 PBRM1Q86U86 1689 aa34.74■■■■□ 3.15
NFS1-209ENST00000456462 SYNJ1O43426 1573 aa34.73■■■■□ 3.15
NFS1-209ENST00000456462 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.64■■■■□ 3.14
NFS1-209ENST00000456462 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.64■■■■□ 3.14
NFS1-209ENST00000456462 ARAP1Q96P48 1450 aa34.54■■■■□ 3.12
NFS1-209ENST00000456462 GRIN2AQ12879 1464 aa34.48■■■■□ 3.11
NFS1-209ENST00000456462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.48■■■■□ 3.11
NFS1-209ENST00000456462 ADAMTS12P58397 1594 aa34.47■■■■□ 3.11
NFS1-209ENST00000456462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.47■■■■□ 3.11
NFS1-209ENST00000456462 NUP160Q12769 1436 aa34.34■■■■□ 3.09
NFS1-209ENST00000456462 CEP170Q5SW79 1584 aa34.27■■■■□ 3.08
NFS1-209ENST00000456462 KIF27Q86VH2 1401 aa34.22■■■■□ 3.07
NFS1-209ENST00000456462 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
NFS1-209ENST00000456462 SHROOM2Q13796 1616 aa34.11■■■■□ 3.05
NFS1-209ENST00000456462 IGF1RP08069 1367 aa34.11■■■■□ 3.05
NFS1-209ENST00000456462 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.05■■■■□ 3.04
NFS1-209ENST00000456462 CUL7Q14999 1698 aa34.04■■■■□ 3.04
NFS1-209ENST00000456462 JPH4Q96JJ6 628 aa34.03■■■■□ 3.04
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