RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.94■■■■■ 5.1
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.87■■■■■ 4.29
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCC9O60706 1549 aa41.6■■■■■ 4.25
ANKRD54-211ENST00000609454 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.78■■■■□ 3.96
ANKRD54-211ENST00000609454 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.76■■■■□ 3.95
ANKRD54-211ENST00000609454 NACADO15069 1562 aa39.55■■■■□ 3.92
ANKRD54-211ENST00000609454 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.08■■■■□ 3.85
ANKRD54-211ENST00000609454 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
ANKRD54-211ENST00000609454 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.88■■■■□ 3.81
ANKRD54-211ENST00000609454 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.74■■■■□ 3.79
ANKRD54-211ENST00000609454 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.66■■■■□ 3.78
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.57■■■■□ 3.76
ANKRD54-211ENST00000609454 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.43■■■■□ 3.74
ANKRD54-211ENST00000609454 SCRIBQ14160 1630 aa38.29■■■■□ 3.72
ANKRD54-211ENST00000609454 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.04■■■■□ 3.68
ANKRD54-211ENST00000609454 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
ANKRD54-211ENST00000609454 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.52■■■■□ 3.6
ANKRD54-211ENST00000609454 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.43■■■■□ 3.58
ANKRD54-211ENST00000609454 NCAPD3P42695 1498 aa36.5■■■■□ 3.43
ANKRD54-211ENST00000609454 SMARCA4P51532 1647 aa36.5■■■■□ 3.43
ANKRD54-211ENST00000609454 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.46■■■■□ 3.43
ANKRD54-211ENST00000609454 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
ANKRD54-211ENST00000609454 SMARCA2P51531 1590 aa36.42■■■■□ 3.42
ANKRD54-211ENST00000609454 HMGXB3Q12766 1538 aa36.24■■■■□ 3.39
ANKRD54-211ENST00000609454 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
ANKRD54-211ENST00000609454 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.16■■■■□ 3.38
ANKRD54-211ENST00000609454 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.08■■■■□ 3.37
ANKRD54-211ENST00000609454 ERCC6Q03468 1493 aa35.99■■■■□ 3.35
ANKRD54-211ENST00000609454 NESP48681 1621 aa35.8■■■■□ 3.32
ANKRD54-211ENST00000609454 WIZO95785 1651 aa35.75■■■■□ 3.31
ANKRD54-211ENST00000609454 CUX2O14529 1486 aa35.66■■■■□ 3.3
ANKRD54-211ENST00000609454 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.63■■■■□ 3.29
ANKRD54-211ENST00000609454 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
ANKRD54-211ENST00000609454 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.52■■■■□ 3.28
ANKRD54-211ENST00000609454 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.49■■■■□ 3.27
ANKRD54-211ENST00000609454 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.3■■■■□ 3.24
ANKRD54-211ENST00000609454 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
ANKRD54-211ENST00000609454 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.19■■■■□ 3.22
ANKRD54-211ENST00000609454 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD54-211ENST00000609454 CFTRP13569 1480 aa35.1■■■■□ 3.21
ANKRD54-211ENST00000609454 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.09■■■■□ 3.21
ANKRD54-211ENST00000609454 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.07■■■■□ 3.2
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.97■■■■□ 3.19
ANKRD54-211ENST00000609454 WDR62O43379 1518 aa34.93■■■■□ 3.18
ANKRD54-211ENST00000609454 PRDM2Q13029 1718 aa34.69■■■■□ 3.14
ANKRD54-211ENST00000609454 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
ANKRD54-211ENST00000609454 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCC8Q09428 1581 aa34.45■■■■□ 3.1
ANKRD54-211ENST00000609454 TOPBP1Q92547 1522 aa34.42■■■■□ 3.1
ANKRD54-211ENST00000609454 IFT140Q96RY7 1462 aa34.36■■■■□ 3.09
ANKRD54-211ENST00000609454 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.32■■■■□ 3.09
ANKRD54-211ENST00000609454 OSCARQ8IYS5 282 aa34.24■■■■□ 3.07
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
ANKRD54-211ENST00000609454 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
ANKRD54-211ENST00000609454 SOGA1O94964 1423 aa34.04■■■■□ 3.04
ANKRD54-211ENST00000609454 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
ANKRD54-211ENST00000609454 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.01■■■■□ 3.04
ANKRD54-211ENST00000609454 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
ANKRD54-211ENST00000609454 TRIM41Q8WV44 630 aa33.99■■■■□ 3.03
ANKRD54-211ENST00000609454 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.99■■■■□ 3.03
ANKRD54-211ENST00000609454 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.96■■■■□ 3.03
ANKRD54-211ENST00000609454 CUX1P39880 1505 aa33.95■■■■□ 3.03
ANKRD54-211ENST00000609454 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
ANKRD54-211ENST00000609454 FBLN2P98095 1184 aa33.91■■■■□ 3.02
ANKRD54-211ENST00000609454 WDR97A6NE52 1622 aa33.73■■■□□ 2.99
ANKRD54-211ENST00000609454 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
ANKRD54-211ENST00000609454 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.68■■■□□ 2.98
ANKRD54-211ENST00000609454 CHD1O14646 1710 aa33.67■■■□□ 2.98
ANKRD54-211ENST00000609454 GRIN2BQ13224 1484 aa33.66■■■□□ 2.98
ANKRD54-211ENST00000609454 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.64■■■□□ 2.98
ANKRD54-211ENST00000609454 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.61■■■□□ 2.97
ANKRD54-211ENST00000609454 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.58■■■□□ 2.97
ANKRD54-211ENST00000609454 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.57■■■□□ 2.96
ANKRD54-211ENST00000609454 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.57■■■□□ 2.96
ANKRD54-211ENST00000609454 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.57■■■□□ 2.96
ANKRD54-211ENST00000609454 TOP2BQ02880 1626 aa33.53■■■□□ 2.96
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGEF11O15085 1522 aa33.53■■■□□ 2.96
ANKRD54-211ENST00000609454 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.49■■■□□ 2.95
ANKRD54-211ENST00000609454 SYNJ1O43426 1573 aa33.48■■■□□ 2.95
ANKRD54-211ENST00000609454 SYNJ2O15056 1496 aa33.48■■■□□ 2.95
ANKRD54-211ENST00000609454 PBRM1Q86U86 1689 aa33.45■■■□□ 2.95
ANKRD54-211ENST00000609454 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.43■■■□□ 2.94
ANKRD54-211ENST00000609454 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.42■■■□□ 2.94
ANKRD54-211ENST00000609454 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.28■■■□□ 2.92
ANKRD54-211ENST00000609454 ARAP1Q96P48 1450 aa33.21■■■□□ 2.91
ANKRD54-211ENST00000609454 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.19■■■□□ 2.9
ANKRD54-211ENST00000609454 GRIN2AQ12879 1464 aa33.19■■■□□ 2.9
ANKRD54-211ENST00000609454 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.18■■■□□ 2.9
ANKRD54-211ENST00000609454 ADAMTS12P58397 1594 aa33.17■■■□□ 2.9
ANKRD54-211ENST00000609454 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
ANKRD54-211ENST00000609454 NUP160Q12769 1436 aa33.02■■■□□ 2.88
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF27Q86VH2 1401 aa33.02■■■□□ 2.88
ANKRD54-211ENST00000609454 CEP170Q5SW79 1584 aa33■■■□□ 2.87
ANKRD54-211ENST00000609454 IGF1RP08069 1367 aa32.89■■■□□ 2.86
ANKRD54-211ENST00000609454 JPH4Q96JJ6 628 aa32.84■■■□□ 2.85
ANKRD54-211ENST00000609454 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.8■■■□□ 2.84
ANKRD54-211ENST00000609454 CUL7Q14999 1698 aa32.78■■■□□ 2.84
ANKRD54-211ENST00000609454 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
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