RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.74■■■■■ 8.59
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ANKRD54-203ENST00000407117 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa55.01■■■■■ 6.4
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ANKRD54-203ENST00000407117 PEG3Q9GZU2 1588 aa53.02■■■■■ 6.08
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ANKRD54-203ENST00000407117 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa52.24■■■■■ 5.95
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ANKRD54-203ENST00000407117 MRC2Q9UBG0 1479 aa51.42■■■■■ 5.82
ANKRD54-203ENST00000407117 CEP164Q9UPV0 1460 aa51.34■■■■■ 5.81
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ANKRD54-203ENST00000407117 WDR62O43379 1518 aa51.28■■■■■ 5.8
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ANKRD54-203ENST00000407117 PRDM2Q13029 1718 aa50.91■■■■■ 5.74
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ANKRD54-203ENST00000407117 IFT140Q96RY7 1462 aa50.31■■■■■ 5.64
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ANKRD54-203ENST00000407117 CHD1O14646 1710 aa49.32■■■■■ 5.49
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ANKRD54-203ENST00000407117 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.21■■■■■ 5.47
ANKRD54-203ENST00000407117 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.21■■■■■ 5.47
ANKRD54-203ENST00000407117 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.21■■■■■ 5.47
ANKRD54-203ENST00000407117 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP49.2■■■■■ 5.47
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ANKRD54-203ENST00000407117 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.55■■■■■ 5.36
ANKRD54-203ENST00000407117 NUP160Q12769 1436 aa48.42■■■■■ 5.34
ANKRD54-203ENST00000407117 CEP170Q5SW79 1584 aa48.34■■■■■ 5.33
ANKRD54-203ENST00000407117 KIF27Q86VH2 1401 aa48.18■■■■■ 5.3
ANKRD54-203ENST00000407117 SHROOM2Q13796 1616 aa48.12■■■■■ 5.29
ANKRD54-203ENST00000407117 IGF1RP08069 1367 aa48.07■■■■■ 5.29
ANKRD54-203ENST00000407117 ERCC6L2Q5T890 1561 aa48.05■■■■■ 5.28
ANKRD54-203ENST00000407117 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.01■■■■■ 5.28
ANKRD54-203ENST00000407117 CUL7Q14999 1698 aa47.97■■■■■ 5.27
ANKRD54-203ENST00000407117 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.91■■■■■ 5.26
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