RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458278.6

ANKRD54-208, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-208ENST00000458278 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.31■■■■■ 4.36
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.78■■■■□ 3.64
ANKRD54-208ENST00000458278 ABCC9O60706 1549 aa37.13■■■■□ 3.53
ANKRD54-208ENST00000458278 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.68■■■■□ 3.3
ANKRD54-208ENST00000458278 NACADO15069 1562 aa35.58■■■■□ 3.29
ANKRD54-208ENST00000458278 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.36■■■■□ 3.25
ANKRD54-208ENST00000458278 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.32■■■■□ 3.25
ANKRD54-208ENST00000458278 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
ANKRD54-208ENST00000458278 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.06■■■■□ 3.2
ANKRD54-208ENST00000458278 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.84■■■■□ 3.17
ANKRD54-208ENST00000458278 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.62■■■■□ 3.13
ANKRD54-208ENST00000458278 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.57■■■■□ 3.13
ANKRD54-208ENST00000458278 SCRIBQ14160 1630 aa34.37■■■■□ 3.09
ANKRD54-208ENST00000458278 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.31■■■■□ 3.08
ANKRD54-208ENST00000458278 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.28■■■■□ 3.08
ANKRD54-208ENST00000458278 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.69■■■□□ 2.98
ANKRD54-208ENST00000458278 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.61■■■□□ 2.97
ANKRD54-208ENST00000458278 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.43■■■□□ 2.94
ANKRD54-208ENST00000458278 SMARCA4P51532 1647 aa32.89■■■□□ 2.86
ANKRD54-208ENST00000458278 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
ANKRD54-208ENST00000458278 NCAPD3P42695 1498 aa32.83■■■□□ 2.85
ANKRD54-208ENST00000458278 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.77■■■□□ 2.84
ANKRD54-208ENST00000458278 SMARCA2P51531 1590 aa32.75■■■□□ 2.83
ANKRD54-208ENST00000458278 HMGXB3Q12766 1538 aa32.66■■■□□ 2.82
ANKRD54-208ENST00000458278 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.62■■■□□ 2.81
ANKRD54-208ENST00000458278 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.57■■■□□ 2.8
ANKRD54-208ENST00000458278 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
ANKRD54-208ENST00000458278 WIZO95785 1651 aa32.21■■■□□ 2.75
ANKRD54-208ENST00000458278 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
ANKRD54-208ENST00000458278 ERCC6Q03468 1493 aa32.06■■■□□ 2.72
ANKRD54-208ENST00000458278 NESP48681 1621 aa32.05■■■□□ 2.72
ANKRD54-208ENST00000458278 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.01■■■□□ 2.71
ANKRD54-208ENST00000458278 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
ANKRD54-208ENST00000458278 CUX2O14529 1486 aa31.86■■■□□ 2.69
ANKRD54-208ENST00000458278 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.83■■■□□ 2.69
ANKRD54-208ENST00000458278 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.79■■■□□ 2.68
ANKRD54-208ENST00000458278 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.7■■■□□ 2.66
ANKRD54-208ENST00000458278 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
ANKRD54-208ENST00000458278 CFTRP13569 1480 aa31.6■■■□□ 2.65
ANKRD54-208ENST00000458278 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.48■■■□□ 2.63
ANKRD54-208ENST00000458278 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.47■■■□□ 2.63
ANKRD54-208ENST00000458278 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.46■■■□□ 2.63
ANKRD54-208ENST00000458278 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.46■■■□□ 2.63
ANKRD54-208ENST00000458278 WDR62O43379 1518 aa31.39■■■□□ 2.61
ANKRD54-208ENST00000458278 PRDM2Q13029 1718 aa31.37■■■□□ 2.61
ANKRD54-208ENST00000458278 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.17■■■□□ 2.58
ANKRD54-208ENST00000458278 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
ANKRD54-208ENST00000458278 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
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ANKRD54-208ENST00000458278 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.88■■■□□ 2.53
ANKRD54-208ENST00000458278 IFT140Q96RY7 1462 aa30.82■■■□□ 2.52
ANKRD54-208ENST00000458278 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
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ANKRD54-208ENST00000458278 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
ANKRD54-208ENST00000458278 CUX1P39880 1505 aa30.58■■■□□ 2.49
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ANKRD54-208ENST00000458278 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.52■■■□□ 2.48
ANKRD54-208ENST00000458278 SOGA1O94964 1423 aa30.51■■■□□ 2.47
ANKRD54-208ENST00000458278 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.48■■■□□ 2.47
ANKRD54-208ENST00000458278 OSCARQ8IYS5 282 aa30.46■■■□□ 2.47
ANKRD54-208ENST00000458278 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
ANKRD54-208ENST00000458278 WDR97A6NE52 1622 aa30.43■■■□□ 2.46
ANKRD54-208ENST00000458278 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
ANKRD54-208ENST00000458278 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
ANKRD54-208ENST00000458278 TOP2BQ02880 1626 aa30.28■■■□□ 2.44
ANKRD54-208ENST00000458278 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.27■■■□□ 2.44
ANKRD54-208ENST00000458278 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.24■■■□□ 2.43
ANKRD54-208ENST00000458278 SYNJ1O43426 1573 aa30.22■■■□□ 2.43
ANKRD54-208ENST00000458278 CHD1O14646 1710 aa30.22■■■□□ 2.43
ANKRD54-208ENST00000458278 GRIN2BQ13224 1484 aa30.2■■■□□ 2.43
ANKRD54-208ENST00000458278 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ANKRD54-208ENST00000458278 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.17■■■□□ 2.42
ANKRD54-208ENST00000458278 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.16■■■□□ 2.42
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ANKRD54-208ENST00000458278 FBLN2P98095 1184 aa30.11■■■□□ 2.41
ANKRD54-208ENST00000458278 SYNJ2O15056 1496 aa30.05■■■□□ 2.4
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ANKRD54-208ENST00000458278 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30■■■□□ 2.39
ANKRD54-208ENST00000458278 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30■■■□□ 2.39
ANKRD54-208ENST00000458278 ARHGEF11O15085 1522 aa29.97■■■□□ 2.39
ANKRD54-208ENST00000458278 TRIM41Q8WV44 630 aa29.96■■■□□ 2.39
ANKRD54-208ENST00000458278 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD54-208ENST00000458278 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.89■■■□□ 2.38
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ANKRD54-208ENST00000458278 ARAP1Q96P48 1450 aa29.7■■■□□ 2.35
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ANKRD54-208ENST00000458278 KIF27Q86VH2 1401 aa29.69■■■□□ 2.34
ANKRD54-208ENST00000458278 CEP170Q5SW79 1584 aa29.66■■■□□ 2.34
ANKRD54-208ENST00000458278 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.66■■■□□ 2.34
ANKRD54-208ENST00000458278 IGF1RP08069 1367 aa29.6■■■□□ 2.33
ANKRD54-208ENST00000458278 CUL7Q14999 1698 aa29.57■■■□□ 2.32
ANKRD54-208ENST00000458278 SHROOM2Q13796 1616 aa29.53■■■□□ 2.32
ANKRD54-208ENST00000458278 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.43■■■□□ 2.3
ANKRD54-208ENST00000458278 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.41■■■□□ 2.3
ANKRD54-208ENST00000458278 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.4■■■□□ 2.3
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