Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 411.25□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC8.86□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.261e-6■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 NAPA-202ENST00000593761 891 ntTSL 519.02■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 NAPA-205ENST00000594001 1417 ntTSL 218.63■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 39.4
GTF2F1P35269 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 318.4■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 39.3
GTF2F1P35269 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 518.4■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 39.3
GTF2F1P35269 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 222.15■■□□□ 1.142e-8■■■■■ 39.2
GTF2F1P35269 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 519.22■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 39.2
GTF2F1P35269 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 218.68■□□□□ 0.582e-8■■■■■ 39.2
GTF2F1P35269 AKT1-210ENST00000554826 572 ntTSL 316.14■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 39.2
GTF2F1P35269 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-9■■■■■ 39.2
GTF2F1P35269 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.662e-16■■■■■ 39.2
GTF2F1P35269 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 217.68■□□□□ 0.422e-16■■■■■ 39.2
GTF2F1P35269 LYPLA2-207ENST00000421070 429 ntTSL 516.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 LYPLA2-209ENST00000492577 717 ntTSL 314.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 56.57□□□□□ -1.363e-15■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.686e-7■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 SIK3-211ENST00000485363 764 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.436e-7■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 SIK3-204ENST00000445177 6331 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.85□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 SIK3-203ENST00000415541 3816 ntTSL 1 (best)9.52□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 TRABD-205ENST00000463233 2404 ntTSL 1 (best)23.2■■□□□ 1.31e-8■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.241e-8■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.911e-8■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-215ENST00000569189 586 ntTSL 526.86■■□□□ 1.898e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-203ENST00000562944 388 ntTSL 525.85■■□□□ 1.738e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-204ENST00000563047 366 ntTSL 524.14■■□□□ 1.458e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-205ENST00000563494 553 ntTSL 523.66■■□□□ 1.388e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-212ENST00000568799 1403 ntTSL 523.4■■□□□ 1.348e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.188e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-202ENST00000562117 387 ntTSL 513.75□□□□□ -0.218e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.298e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-217ENST00000570111 563 ntTSL 58.91□□□□□ -0.988e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-207ENST00000566651 332 ntTSL 38.17□□□□□ -1.18e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 GGA2-216ENST00000569300 572 ntTSL 45.98□□□□□ -1.458e-10■■■■■ 39.1
GTF2F1P35269 DLG4-204ENST00000447163 763 ntTSL 517.36■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 39
GTF2F1P35269 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 39
GTF2F1P35269 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.373e-41■■■■■ 39
GTF2F1P35269 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.113e-41■■■■■ 39
GTF2F1P35269 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.873e-41■■■■■ 39
GTF2F1P35269 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-41■■■■■ 39
GTF2F1P35269 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 214.06□□□□□ -0.163e-41■■■■■ 39
GTF2F1P35269 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)29.94■■■□□ 2.381e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.012e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)27.07■■□□□ 1.921e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 GRIN2C-203ENST00000578159 615 ntTSL 326.32■■□□□ 1.81e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 GRIN2C-205ENST00000584496 1984 ntTSL 1 (best)25.52■■□□□ 1.681e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.521e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.471e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 C1orf35-207ENST00000492757 548 ntTSL 323.37■■□□□ 1.331e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 CD63-211ENST00000551173 788 ntTSL 322.94■■□□□ 1.261e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-226ENST00000450424 2658 ntTSL 522.14■■□□□ 1.131e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 LGI4-204ENST00000493050 2200 ntTSL 1 (best)21.59■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 39
GTF2F1P35269 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.91e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-206ENST00000473527 1005 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.841e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.841e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 GRIN2C-204ENST00000584176 6516 ntTSL 220.28■□□□□ 0.841e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 ZNF628-202ENST00000591164 472 ntTSL 220.11■□□□□ 0.811e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.81e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 519.99■□□□□ 0.791e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-210ENST00000421110 2755 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-213ENST00000426123 2907 ntTSL 219.39■□□□□ 0.691e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-208ENST00000480497 530 ntTSL 319.25■□□□□ 0.671e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-209ENST00000482199 731 ntTSL 319.25■□□□□ 0.671e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.671e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.531e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 DBNDD1-205ENST00000568662 563 ntTSL 218.34■□□□□ 0.531e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.511e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 TSNARE1-202ENST00000518720 583 ntTSL 418.25■□□□□ 0.511e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-208ENST00000413967 2808 ntTSL 218.12■□□□□ 0.491e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-204ENST00000449367 745 ntTSL 217.96■□□□□ 0.471e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.371e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.331e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 TSNARE1-206ENST00000520462 589 ntTSL 416.98■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.281e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-202ENST00000435848 692 ntTSL 516.31■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)16.03■□□□□ 0.161e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 ACSF3-215ENST00000544543 883 ntTSL 514.79□□□□□ -0.045e-9■■■■■ 39
GTF2F1P35269 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 39
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 95.6 ms