RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578159.1

GRIN2C-203, Transcript of glutamate ionotropic receptor NMDA type subunit 2C, humanhuman

TSL 3

Gene GRIN2C, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2C-203ENST00000578159 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.21■■■■■ 6.91
GRIN2C-203ENST00000578159 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.05■■■■■ 5.92
GRIN2C-203ENST00000578159 ABCC9O60706 1549 aa51.68■■■■■ 5.86
GRIN2C-203ENST00000578159 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.4■■■■■ 5.5
GRIN2C-203ENST00000578159 NACADO15069 1562 aa49.15■■■■■ 5.46
GRIN2C-203ENST00000578159 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.04■■■■■ 5.44
GRIN2C-203ENST00000578159 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.61■■■■■ 5.37
GRIN2C-203ENST00000578159 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
GRIN2C-203ENST00000578159 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.19■■■■■ 5.3
GRIN2C-203ENST00000578159 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.18■■■■■ 5.3
GRIN2C-203ENST00000578159 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.12■■■■■ 5.29
GRIN2C-203ENST00000578159 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.11■■■■■ 5.29
GRIN2C-203ENST00000578159 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.87■■■■■ 5.25
GRIN2C-203ENST00000578159 SCRIBQ14160 1630 aa47.44■■■■■ 5.18
GRIN2C-203ENST00000578159 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.35■■■■■ 5.17
GRIN2C-203ENST00000578159 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.07
GRIN2C-203ENST00000578159 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.69■■■■■ 5.07
GRIN2C-203ENST00000578159 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.53■■■■■ 5.04
GRIN2C-203ENST00000578159 NCAPD3P42695 1498 aa45.37■■■■■ 4.85
GRIN2C-203ENST00000578159 SMARCA4P51532 1647 aa45.3■■■■■ 4.84
GRIN2C-203ENST00000578159 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.27■■■■■ 4.84
GRIN2C-203ENST00000578159 SMARCA2P51531 1590 aa45.2■■■■■ 4.83
GRIN2C-203ENST00000578159 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
GRIN2C-203ENST00000578159 HMGXB3Q12766 1538 aa45.05■■■■■ 4.8
GRIN2C-203ENST00000578159 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.87■■■■■ 4.77
GRIN2C-203ENST00000578159 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
GRIN2C-203ENST00000578159 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.83■■■■■ 4.77
GRIN2C-203ENST00000578159 ERCC6Q03468 1493 aa44.63■■■■■ 4.73
GRIN2C-203ENST00000578159 NESP48681 1621 aa44.48■■■■■ 4.71
GRIN2C-203ENST00000578159 CUX2O14529 1486 aa44.4■■■■■ 4.7
GRIN2C-203ENST00000578159 WIZO95785 1651 aa44.3■■■■■ 4.68
GRIN2C-203ENST00000578159 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.28■■■■■ 4.68
GRIN2C-203ENST00000578159 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
GRIN2C-203ENST00000578159 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.06■■■■■ 4.64
GRIN2C-203ENST00000578159 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.03■■■■■ 4.64
GRIN2C-203ENST00000578159 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.96■■■■■ 4.63
GRIN2C-203ENST00000578159 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
GRIN2C-203ENST00000578159 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.91■■■■■ 4.62
GRIN2C-203ENST00000578159 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
GRIN2C-203ENST00000578159 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.61■■■■■ 4.57
GRIN2C-203ENST00000578159 CFTRP13569 1480 aa43.58■■■■■ 4.57
GRIN2C-203ENST00000578159 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.52■■■■■ 4.56
GRIN2C-203ENST00000578159 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.51■■■■■ 4.56
GRIN2C-203ENST00000578159 WDR62O43379 1518 aa43.46■■■■■ 4.55
GRIN2C-203ENST00000578159 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.31■■■■■ 4.52
GRIN2C-203ENST00000578159 PRDM2Q13029 1718 aa43.14■■■■■ 4.5
GRIN2C-203ENST00000578159 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
GRIN2C-203ENST00000578159 ABCC8Q09428 1581 aa42.72■■■■■ 4.43
GRIN2C-203ENST00000578159 TOPBP1Q92547 1522 aa42.71■■■■■ 4.43
GRIN2C-203ENST00000578159 IFT140Q96RY7 1462 aa42.65■■■■■ 4.42
GRIN2C-203ENST00000578159 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.59■■■■■ 4.41
GRIN2C-203ENST00000578159 OSCARQ8IYS5 282 aa42.5■■■■■ 4.39
GRIN2C-203ENST00000578159 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
GRIN2C-203ENST00000578159 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
GRIN2C-203ENST00000578159 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
GRIN2C-203ENST00000578159 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
GRIN2C-203ENST00000578159 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
GRIN2C-203ENST00000578159 TRIM41Q8WV44 630 aa42.19■■■■■ 4.34
GRIN2C-203ENST00000578159 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.18■■■■■ 4.34
GRIN2C-203ENST00000578159 SOGA1O94964 1423 aa42.15■■■■■ 4.34
GRIN2C-203ENST00000578159 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.13■■■■■ 4.34
GRIN2C-203ENST00000578159 CUX1P39880 1505 aa42.1■■■■■ 4.33
GRIN2C-203ENST00000578159 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.09■■■■■ 4.33
GRIN2C-203ENST00000578159 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
GRIN2C-203ENST00000578159 WDR97A6NE52 1622 aa41.93■■■■■ 4.3
GRIN2C-203ENST00000578159 FBLN2P98095 1184 aa41.89■■■■■ 4.3
GRIN2C-203ENST00000578159 CHD1O14646 1710 aa41.87■■■■■ 4.29
GRIN2C-203ENST00000578159 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
GRIN2C-203ENST00000578159 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
GRIN2C-203ENST00000578159 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.8■■■■■ 4.28
GRIN2C-203ENST00000578159 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.76■■■■■ 4.28
GRIN2C-203ENST00000578159 GRIN2BQ13224 1484 aa41.74■■■■■ 4.27
GRIN2C-203ENST00000578159 ARHGEF11O15085 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
GRIN2C-203ENST00000578159 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
GRIN2C-203ENST00000578159 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.65■■■■■ 4.26
GRIN2C-203ENST00000578159 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
GRIN2C-203ENST00000578159 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.64■■■■■ 4.26
GRIN2C-203ENST00000578159 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
GRIN2C-203ENST00000578159 TOP2BQ02880 1626 aa41.55■■■■■ 4.24
GRIN2C-203ENST00000578159 SYNJ2O15056 1496 aa41.54■■■■■ 4.24
GRIN2C-203ENST00000578159 PBRM1Q86U86 1689 aa41.54■■■■■ 4.24
GRIN2C-203ENST00000578159 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.53■■■■■ 4.24
GRIN2C-203ENST00000578159 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.51■■■■■ 4.24
GRIN2C-203ENST00000578159 SYNJ1O43426 1573 aa41.48■■■■■ 4.23
GRIN2C-203ENST00000578159 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.46■■■■■ 4.23
GRIN2C-203ENST00000578159 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.42■■■■■ 4.22
GRIN2C-203ENST00000578159 ARAP1Q96P48 1450 aa41.34■■■■■ 4.21
GRIN2C-203ENST00000578159 ADAMTS12P58397 1594 aa41.18■■■■■ 4.18
GRIN2C-203ENST00000578159 GRIN2AQ12879 1464 aa41.18■■■■■ 4.18
GRIN2C-203ENST00000578159 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.14■■■■■ 4.18
GRIN2C-203ENST00000578159 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.14■■■■■ 4.18
GRIN2C-203ENST00000578159 NUP160Q12769 1436 aa41.02■■■■■ 4.16
GRIN2C-203ENST00000578159 CEP170Q5SW79 1584 aa40.98■■■■■ 4.15
GRIN2C-203ENST00000578159 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
GRIN2C-203ENST00000578159 KIF27Q86VH2 1401 aa40.81■■■■■ 4.12
GRIN2C-203ENST00000578159 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.78■■■■■ 4.12
GRIN2C-203ENST00000578159 SHROOM2Q13796 1616 aa40.77■■■■■ 4.12
GRIN2C-203ENST00000578159 IGF1RP08069 1367 aa40.72■■■■■ 4.11
GRIN2C-203ENST00000578159 JPH4Q96JJ6 628 aa40.66■■■■■ 4.1
GRIN2C-203ENST00000578159 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 194.8 ms