Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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CTF1Q16619 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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CTF1Q16619 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CTF1Q16619 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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CTF1Q16619 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CTF1Q16619 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CTF1Q16619 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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