RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253451.8

CCL25-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CCL25, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL25-201ENST00000253451 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.31■■■■□ 3.56
CCL25-201ENST00000253451 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.99■■■□□ 2.87
CCL25-201ENST00000253451 ABCC9O60706 1549 aa31.75■■■□□ 2.67
CCL25-201ENST00000253451 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
CCL25-201ENST00000253451 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.88■■■□□ 2.53
CCL25-201ENST00000253451 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.87■■■□□ 2.53
CCL25-201ENST00000253451 NACADO15069 1562 aa30.82■■■□□ 2.52
CCL25-201ENST00000253451 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.78■■■□□ 2.52
CCL25-201ENST00000253451 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.75■■■□□ 2.51
CCL25-201ENST00000253451 SCRIBQ14160 1630 aa30.18■■■□□ 2.42
CCL25-201ENST00000253451 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.17■■■□□ 2.42
CCL25-201ENST00000253451 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.86■■■□□ 2.37
CCL25-201ENST00000253451 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.86■■■□□ 2.37
CCL25-201ENST00000253451 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.35
CCL25-201ENST00000253451 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.63■■■□□ 2.33
CCL25-201ENST00000253451 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.04■■■□□ 2.24
CCL25-201ENST00000253451 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CCL25-201ENST00000253451 SMARCA4P51532 1647 aa28.89■■■□□ 2.22
CCL25-201ENST00000253451 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CCL25-201ENST00000253451 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.81■■■□□ 2.2
CCL25-201ENST00000253451 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.75■■■□□ 2.19
CCL25-201ENST00000253451 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CCL25-201ENST00000253451 WIZO95785 1651 aa28.55■■■□□ 2.16
CCL25-201ENST00000253451 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.55■■■□□ 2.16
CCL25-201ENST00000253451 SMARCA2P51531 1590 aa28.54■■■□□ 2.16
CCL25-201ENST00000253451 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.53■■■□□ 2.16
CCL25-201ENST00000253451 NCAPD3P42695 1498 aa28.4■■■□□ 2.14
CCL25-201ENST00000253451 HMGXB3Q12766 1538 aa28.38■■■□□ 2.13
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CCL25-201ENST00000253451 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CCL25-201ENST00000253451 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.89■■■□□ 2.05
CCL25-201ENST00000253451 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.75■■■□□ 2.03
CCL25-201ENST00000253451 NESP48681 1621 aa27.65■■■□□ 2.02
CCL25-201ENST00000253451 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.61■■■□□ 2.01
CCL25-201ENST00000253451 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.6■■■□□ 2.01
CCL25-201ENST00000253451 CFTRP13569 1480 aa27.57■■■□□ 2
CCL25-201ENST00000253451 PRDM2Q13029 1718 aa27.53■■■□□ 2
CCL25-201ENST00000253451 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.39■■□□□ 1.97
CCL25-201ENST00000253451 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.35■■□□□ 1.97
CCL25-201ENST00000253451 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.33■■□□□ 1.97
CCL25-201ENST00000253451 ERCC6Q03468 1493 aa27.29■■□□□ 1.96
CCL25-201ENST00000253451 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.25■■□□□ 1.95
CCL25-201ENST00000253451 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CCL25-201ENST00000253451 ABCC8Q09428 1581 aa27.11■■□□□ 1.93
CCL25-201ENST00000253451 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.11■■□□□ 1.93
CCL25-201ENST00000253451 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CCL25-201ENST00000253451 WDR62O43379 1518 aa27.02■■□□□ 1.92
CCL25-201ENST00000253451 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.01■■□□□ 1.91
CCL25-201ENST00000253451 CUX1P39880 1505 aa27■■□□□ 1.91
CCL25-201ENST00000253451 TOPBP1Q92547 1522 aa26.98■■□□□ 1.91
CCL25-201ENST00000253451 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
CCL25-201ENST00000253451 SYNJ1O43426 1573 aa26.97■■□□□ 1.91
CCL25-201ENST00000253451 CUX2O14529 1486 aa26.93■■□□□ 1.9
CCL25-201ENST00000253451 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.92■■□□□ 1.9
CCL25-201ENST00000253451 TOP2BQ02880 1626 aa26.9■■□□□ 1.9
CCL25-201ENST00000253451 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.81■■□□□ 1.88
CCL25-201ENST00000253451 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CCL25-201ENST00000253451 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.7■■□□□ 1.86
CCL25-201ENST00000253451 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.67■■□□□ 1.86
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CCL25-201ENST00000253451 TRIM41Q8WV44 630 aa26.64■■□□□ 1.86
CCL25-201ENST00000253451 WDR97A6NE52 1622 aa26.64■■□□□ 1.85
CCL25-201ENST00000253451 IFT140Q96RY7 1462 aa26.63■■□□□ 1.85
CCL25-201ENST00000253451 SOGA1O94964 1423 aa26.63■■□□□ 1.85
CCL25-201ENST00000253451 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.55■■□□□ 1.84
CCL25-201ENST00000253451 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CCL25-201ENST00000253451 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
CCL25-201ENST00000253451 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.46■■□□□ 1.83
CCL25-201ENST00000253451 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CCL25-201ENST00000253451 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
CCL25-201ENST00000253451 PBRM1Q86U86 1689 aa26.38■■□□□ 1.81
CCL25-201ENST00000253451 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.36■■□□□ 1.81
CCL25-201ENST00000253451 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.34■■□□□ 1.81
CCL25-201ENST00000253451 KIF27Q86VH2 1401 aa26.34■■□□□ 1.81
CCL25-201ENST00000253451 GRIN2BQ13224 1484 aa26.27■■□□□ 1.8
CCL25-201ENST00000253451 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.24■■□□□ 1.79
CCL25-201ENST00000253451 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.22■■□□□ 1.79
CCL25-201ENST00000253451 EEA1Q15075 1411 aa26.18■■□□□ 1.78
CCL25-201ENST00000253451 ADAMTS12P58397 1594 aa26.17■■□□□ 1.78
CCL25-201ENST00000253451 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CCL25-201ENST00000253451 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CCL25-201ENST00000253451 IGF1RP08069 1367 aa26.15■■□□□ 1.78
CCL25-201ENST00000253451 CUL7Q14999 1698 aa26.14■■□□□ 1.78
CCL25-201ENST00000253451 CHD1O14646 1710 aa26.07■■□□□ 1.76
CCL25-201ENST00000253451 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.05■■□□□ 1.76
CCL25-201ENST00000253451 SYNJ2O15056 1496 aa26.04■■□□□ 1.76
CCL25-201ENST00000253451 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.03■■□□□ 1.76
CCL25-201ENST00000253451 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.02■■□□□ 1.76
CCL25-201ENST00000253451 PRXQ9BXM0 1461 aa26■■□□□ 1.75
CCL25-201ENST00000253451 GRIN2AQ12879 1464 aa25.97■■□□□ 1.75
CCL25-201ENST00000253451 KIF21BO75037 1637 aa25.96■■□□□ 1.75
CCL25-201ENST00000253451 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.94■■□□□ 1.74
CCL25-201ENST00000253451 FBLN2P98095 1184 aa25.93■■□□□ 1.74
CCL25-201ENST00000253451 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CCL25-201ENST00000253451 CEP170Q5SW79 1584 aa25.86■■□□□ 1.73
CCL25-201ENST00000253451 GOLGA3Q08378 1498 aa25.82■■□□□ 1.72
CCL25-201ENST00000253451 NUP160Q12769 1436 aa25.81■■□□□ 1.72
CCL25-201ENST00000253451 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.8■■□□□ 1.72
CCL25-201ENST00000253451 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.78■■□□□ 1.72
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