Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CTF1Q16619 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CTF1Q16619 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTF1Q16619 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTF1Q16619 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTF1Q16619 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTF1Q16619 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CTF1Q16619 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTF1Q16619 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTF1Q16619 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTF1Q16619 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTF1Q16619 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTF1Q16619 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CTF1Q16619 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTF1Q16619 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTF1Q16619 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTF1Q16619 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CTF1Q16619 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTF1Q16619 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTF1Q16619 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTF1Q16619 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTF1Q16619 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTF1Q16619 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTF1Q16619 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTF1Q16619 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTF1Q16619 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTF1Q16619 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTF1Q16619 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTF1Q16619 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTF1Q16619 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTF1Q16619 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTF1Q16619 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTF1Q16619 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTF1Q16619 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTF1Q16619 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTF1Q16619 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTF1Q16619 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTF1Q16619 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTF1Q16619 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTF1Q16619 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTF1Q16619 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTF1Q16619 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTF1Q16619 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTF1Q16619 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTF1Q16619 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTF1Q16619 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTF1Q16619 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTF1Q16619 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTF1Q16619 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTF1Q16619 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTF1Q16619 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTF1Q16619 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTF1Q16619 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTF1Q16619 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTF1Q16619 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTF1Q16619 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTF1Q16619 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTF1Q16619 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTF1Q16619 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTF1Q16619 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTF1Q16619 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTF1Q16619 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTF1Q16619 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTF1Q16619 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTF1Q16619 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTF1Q16619 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTF1Q16619 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTF1Q16619 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTF1Q16619 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTF1Q16619 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTF1Q16619 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTF1Q16619 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTF1Q16619 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTF1Q16619 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTF1Q16619 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTF1Q16619 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTF1Q16619 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTF1Q16619 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTF1Q16619 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTF1Q16619 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTF1Q16619 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTF1Q16619 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTF1Q16619 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTF1Q16619 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTF1Q16619 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTF1Q16619 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTF1Q16619 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTF1Q16619 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTF1Q16619 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTF1Q16619 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTF1Q16619 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTF1Q16619 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTF1Q16619 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTF1Q16619 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTF1Q16619 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTF1Q16619 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTF1Q16619 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTF1Q16619 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTF1Q16619 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTF1Q16619 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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