RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445180.2

LINC01648-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1648, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC01648, Length 1,519 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01648-201ENST00000445180 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.27■■■□□ 2.92
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LINC01648-201ENST00000445180 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.51■■□□□ 1.99
LINC01648-201ENST00000445180 ABCC9O60706 1549 aa27.4■■□□□ 1.98
LINC01648-201ENST00000445180 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.22■■□□□ 1.95
LINC01648-201ENST00000445180 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.09■■□□□ 1.93
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LINC01648-201ENST00000445180 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.76■■□□□ 1.87
LINC01648-201ENST00000445180 SCRIBQ14160 1630 aa26.59■■□□□ 1.85
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LINC01648-201ENST00000445180 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
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LINC01648-201ENST00000445180 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
LINC01648-201ENST00000445180 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.69■■□□□ 1.7
LINC01648-201ENST00000445180 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
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LINC01648-201ENST00000445180 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.25■■□□□ 1.63
LINC01648-201ENST00000445180 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LINC01648-201ENST00000445180 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.16■■□□□ 1.62
LINC01648-201ENST00000445180 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LINC01648-201ENST00000445180 SMARCA2P51531 1590 aa25.12■■□□□ 1.61
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LINC01648-201ENST00000445180 NCAPD3P42695 1498 aa24.98■■□□□ 1.59
LINC01648-201ENST00000445180 HMGXB3Q12766 1538 aa24.88■■□□□ 1.57
LINC01648-201ENST00000445180 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.78■■□□□ 1.56
LINC01648-201ENST00000445180 TRIM41Q8WV44 630 aa24.6■■□□□ 1.53
LINC01648-201ENST00000445180 CFTRP13569 1480 aa24.41■■□□□ 1.5
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LINC01648-201ENST00000445180 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.35■■□□□ 1.49
LINC01648-201ENST00000445180 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.48
LINC01648-201ENST00000445180 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.25■■□□□ 1.47
LINC01648-201ENST00000445180 PRDM2Q13029 1718 aa24.14■■□□□ 1.45
LINC01648-201ENST00000445180 SYNJ1O43426 1573 aa24.13■■□□□ 1.45
LINC01648-201ENST00000445180 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
LINC01648-201ENST00000445180 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.09■■□□□ 1.45
LINC01648-201ENST00000445180 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.07■■□□□ 1.44
LINC01648-201ENST00000445180 TOP2BQ02880 1626 aa24.06■■□□□ 1.44
LINC01648-201ENST00000445180 NESP48681 1621 aa24.06■■□□□ 1.44
LINC01648-201ENST00000445180 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.02■■□□□ 1.44
LINC01648-201ENST00000445180 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.02■■□□□ 1.44
LINC01648-201ENST00000445180 CUX1P39880 1505 aa24■■□□□ 1.43
LINC01648-201ENST00000445180 SOGA1O94964 1423 aa23.99■■□□□ 1.43
LINC01648-201ENST00000445180 EEA1Q15075 1411 aa23.98■■□□□ 1.43
LINC01648-201ENST00000445180 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.93■■□□□ 1.42
LINC01648-201ENST00000445180 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.89■■□□□ 1.42
LINC01648-201ENST00000445180 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.89■■□□□ 1.42
LINC01648-201ENST00000445180 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.85■■□□□ 1.41
LINC01648-201ENST00000445180 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.78■■□□□ 1.4
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LINC01648-201ENST00000445180 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.72■■□□□ 1.39
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LINC01648-201ENST00000445180 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.69■■□□□ 1.38
LINC01648-201ENST00000445180 KIF27Q86VH2 1401 aa23.69■■□□□ 1.38
LINC01648-201ENST00000445180 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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LINC01648-201ENST00000445180 GOLGA3Q08378 1498 aa23.6■■□□□ 1.37
LINC01648-201ENST00000445180 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.59■■□□□ 1.37
LINC01648-201ENST00000445180 KIF21BO75037 1637 aa23.59■■□□□ 1.37
LINC01648-201ENST00000445180 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.59■■□□□ 1.37
LINC01648-201ENST00000445180 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.57■■□□□ 1.36
LINC01648-201ENST00000445180 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.56■■□□□ 1.36
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LINC01648-201ENST00000445180 IFT140Q96RY7 1462 aa23.32■■□□□ 1.32
LINC01648-201ENST00000445180 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.31■■□□□ 1.32
LINC01648-201ENST00000445180 CLIP1P30622 1438 aa23.24■■□□□ 1.31
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LINC01648-201ENST00000445180 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
LINC01648-201ENST00000445180 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
LINC01648-201ENST00000445180 GRIN2BQ13224 1484 aa23.15■■□□□ 1.3
LINC01648-201ENST00000445180 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
LINC01648-201ENST00000445180 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.09■■□□□ 1.29
LINC01648-201ENST00000445180 PBRM1Q86U86 1689 aa23.08■■□□□ 1.29
LINC01648-201ENST00000445180 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.03■■□□□ 1.28
LINC01648-201ENST00000445180 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LINC01648-201ENST00000445180 ADAMTS12P58397 1594 aa23■■□□□ 1.27
LINC01648-201ENST00000445180 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LINC01648-201ENST00000445180 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23■■□□□ 1.27
LINC01648-201ENST00000445180 ARAP1Q96P48 1450 aa22.99■■□□□ 1.27
LINC01648-201ENST00000445180 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.95■■□□□ 1.26
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