Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATP1A4Q13733 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATP1A4Q13733 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP1A4Q13733 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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