Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ATP1A4Q13733 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ATP1A4Q13733 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ATP1A4Q13733 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ATP1A4Q13733 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP1A4Q13733 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP1A4Q13733 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATP1A4Q13733 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP1A4Q13733 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATP1A4Q13733 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ATP1A4Q13733 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ATP1A4Q13733 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ATP1A4Q13733 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP1A4Q13733 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ATP1A4Q13733 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ATP1A4Q13733 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP1A4Q13733 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP1A4Q13733 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP1A4Q13733 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP1A4Q13733 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP1A4Q13733 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP1A4Q13733 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP1A4Q13733 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATP1A4Q13733 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP1A4Q13733 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP1A4Q13733 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP1A4Q13733 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP1A4Q13733 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP1A4Q13733 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP1A4Q13733 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP1A4Q13733 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP1A4Q13733 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP1A4Q13733 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP1A4Q13733 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP1A4Q13733 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP1A4Q13733 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP1A4Q13733 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP1A4Q13733 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP1A4Q13733 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP1A4Q13733 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP1A4Q13733 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP1A4Q13733 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP1A4Q13733 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP1A4Q13733 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP1A4Q13733 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP1A4Q13733 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP1A4Q13733 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP1A4Q13733 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP1A4Q13733 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP1A4Q13733 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP1A4Q13733 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP1A4Q13733 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP1A4Q13733 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ATP1A4Q13733 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP1A4Q13733 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP1A4Q13733 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP1A4Q13733 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP1A4Q13733 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP1A4Q13733 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP1A4Q13733 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP1A4Q13733 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP1A4Q13733 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP1A4Q13733 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP1A4Q13733 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP1A4Q13733 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP1A4Q13733 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP1A4Q13733 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP1A4Q13733 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP1A4Q13733 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP1A4Q13733 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP1A4Q13733 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP1A4Q13733 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP1A4Q13733 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A4Q13733 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP1A4Q13733 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP1A4Q13733 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP1A4Q13733 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP1A4Q13733 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP1A4Q13733 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A4Q13733 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP1A4Q13733 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A4Q13733 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A4Q13733 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A4Q13733 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP1A4Q13733 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP1A4Q13733 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP1A4Q13733 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP1A4Q13733 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP1A4Q13733 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A4Q13733 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A4Q13733 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP1A4Q13733 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP1A4Q13733 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A4Q13733 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP1A4Q13733 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP1A4Q13733 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A4Q13733 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP1A4Q13733 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP1A4Q13733 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
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