Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SPIBQ01892 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms