Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TAF4BQ92750 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms