RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594216.1

RAB11B-202, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

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Gene RAB11B, Length 894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-202ENST00000594216 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.35■■■■□ 3.57
RAB11B-202ENST00000594216 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.17■■■□□ 2.9
RAB11B-202ENST00000594216 ABCC9O60706 1549 aa32.57■■■□□ 2.8
RAB11B-202ENST00000594216 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.33■■■□□ 2.61
RAB11B-202ENST00000594216 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.29■■■□□ 2.6
RAB11B-202ENST00000594216 NACADO15069 1562 aa31.23■■■□□ 2.59
RAB11B-202ENST00000594216 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
RAB11B-202ENST00000594216 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.02■■■□□ 2.56
RAB11B-202ENST00000594216 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.88■■■□□ 2.53
RAB11B-202ENST00000594216 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.47■■■□□ 2.47
RAB11B-202ENST00000594216 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.46■■■□□ 2.47
RAB11B-202ENST00000594216 SCRIBQ14160 1630 aa30.33■■■□□ 2.45
RAB11B-202ENST00000594216 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.3■■■□□ 2.44
RAB11B-202ENST00000594216 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30■■■□□ 2.39
RAB11B-202ENST00000594216 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.9■■■□□ 2.38
RAB11B-202ENST00000594216 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
RAB11B-202ENST00000594216 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.42■■■□□ 2.3
RAB11B-202ENST00000594216 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.27■■■□□ 2.28
RAB11B-202ENST00000594216 SMARCA4P51532 1647 aa28.98■■■□□ 2.23
RAB11B-202ENST00000594216 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
RAB11B-202ENST00000594216 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.85■■■□□ 2.21
RAB11B-202ENST00000594216 NCAPD3P42695 1498 aa28.84■■■□□ 2.21
RAB11B-202ENST00000594216 SMARCA2P51531 1590 aa28.81■■■□□ 2.2
RAB11B-202ENST00000594216 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.79■■■□□ 2.2
RAB11B-202ENST00000594216 HMGXB3Q12766 1538 aa28.68■■■□□ 2.18
RAB11B-202ENST00000594216 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.67■■■□□ 2.18
RAB11B-202ENST00000594216 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.17
RAB11B-202ENST00000594216 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
RAB11B-202ENST00000594216 WIZO95785 1651 aa28.45■■■□□ 2.15
RAB11B-202ENST00000594216 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RAB11B-202ENST00000594216 NESP48681 1621 aa28.16■■■□□ 2.1
RAB11B-202ENST00000594216 ERCC6Q03468 1493 aa28.11■■■□□ 2.09
RAB11B-202ENST00000594216 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.07■■■□□ 2.08
RAB11B-202ENST00000594216 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.01■■■□□ 2.07
RAB11B-202ENST00000594216 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB11B-202ENST00000594216 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.85■■■□□ 2.05
RAB11B-202ENST00000594216 CFTRP13569 1480 aa27.83■■■□□ 2.04
RAB11B-202ENST00000594216 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
RAB11B-202ENST00000594216 CUX2O14529 1486 aa27.77■■■□□ 2.04
RAB11B-202ENST00000594216 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.77■■■□□ 2.04
RAB11B-202ENST00000594216 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
RAB11B-202ENST00000594216 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.7■■■□□ 2.02
RAB11B-202ENST00000594216 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.67■■■□□ 2.02
RAB11B-202ENST00000594216 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.63■■■□□ 2.01
RAB11B-202ENST00000594216 WDR62O43379 1518 aa27.51■■■□□ 2
RAB11B-202ENST00000594216 PRDM2Q13029 1718 aa27.5■■□□□ 1.99
RAB11B-202ENST00000594216 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
RAB11B-202ENST00000594216 TOPBP1Q92547 1522 aa27.23■■□□□ 1.95
RAB11B-202ENST00000594216 ABCC8Q09428 1581 aa27.22■■□□□ 1.95
RAB11B-202ENST00000594216 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.18■■□□□ 1.94
RAB11B-202ENST00000594216 IFT140Q96RY7 1462 aa27.08■■□□□ 1.93
RAB11B-202ENST00000594216 CUX1P39880 1505 aa27.01■■□□□ 1.91
RAB11B-202ENST00000594216 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
RAB11B-202ENST00000594216 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.97■■□□□ 1.91
RAB11B-202ENST00000594216 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
RAB11B-202ENST00000594216 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.94■■□□□ 1.9
RAB11B-202ENST00000594216 SOGA1O94964 1423 aa26.91■■□□□ 1.9
RAB11B-202ENST00000594216 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RAB11B-202ENST00000594216 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.9■■□□□ 1.9
RAB11B-202ENST00000594216 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
RAB11B-202ENST00000594216 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RAB11B-202ENST00000594216 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.81■■□□□ 1.887e-12■■■□□ 15.7
RAB11B-202ENST00000594216 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
RAB11B-202ENST00000594216 SYNJ1O43426 1573 aa26.76■■□□□ 1.87
RAB11B-202ENST00000594216 TOP2BQ02880 1626 aa26.76■■□□□ 1.87
RAB11B-202ENST00000594216 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.73■■□□□ 1.87
RAB11B-202ENST00000594216 WDR97A6NE52 1622 aa26.69■■□□□ 1.86
RAB11B-202ENST00000594216 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.66■■□□□ 1.86
RAB11B-202ENST00000594216 OSCARQ8IYS5 282 aa26.66■■□□□ 1.86
RAB11B-202ENST00000594216 GRIN2BQ13224 1484 aa26.6■■□□□ 1.85
RAB11B-202ENST00000594216 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.6■■□□□ 1.85
RAB11B-202ENST00000594216 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.57■■□□□ 1.84
RAB11B-202ENST00000594216 FBLN2P98095 1184 aa26.55■■□□□ 1.84
RAB11B-202ENST00000594216 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.54■■□□□ 1.84
RAB11B-202ENST00000594216 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
RAB11B-202ENST00000594216 PBRM1Q86U86 1689 aa26.47■■□□□ 1.83
RAB11B-202ENST00000594216 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
RAB11B-202ENST00000594216 CHD1O14646 1710 aa26.45■■□□□ 1.83
RAB11B-202ENST00000594216 SYNJ2O15056 1496 aa26.42■■□□□ 1.82
RAB11B-202ENST00000594216 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.34■■□□□ 1.81
RAB11B-202ENST00000594216 KIF27Q86VH2 1401 aa26.31■■□□□ 1.8
RAB11B-202ENST00000594216 ADAMTS12P58397 1594 aa26.3■■□□□ 1.8
RAB11B-202ENST00000594216 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.29■■□□□ 1.8
RAB11B-202ENST00000594216 GRIN2AQ12879 1464 aa26.24■■□□□ 1.79
RAB11B-202ENST00000594216 TRIM41Q8WV44 630 aa26.24■■□□□ 1.79
RAB11B-202ENST00000594216 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.2■■□□□ 1.79
RAB11B-202ENST00000594216 ARHGEF11O15085 1522 aa26.19■■□□□ 1.78
RAB11B-202ENST00000594216 IGF1RP08069 1367 aa26.19■■□□□ 1.78
RAB11B-202ENST00000594216 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.17■■□□□ 1.78
RAB11B-202ENST00000594216 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.17■■□□□ 1.78
RAB11B-202ENST00000594216 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.17■■□□□ 1.78
RAB11B-202ENST00000594216 NUP160Q12769 1436 aa26.13■■□□□ 1.77
RAB11B-202ENST00000594216 CEP170Q5SW79 1584 aa26.09■■□□□ 1.77
RAB11B-202ENST00000594216 CUL7Q14999 1698 aa26.08■■□□□ 1.77
RAB11B-202ENST00000594216 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.05■■□□□ 1.76
RAB11B-202ENST00000594216 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.03■■□□□ 1.76
RAB11B-202ENST00000594216 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26■■□□□ 1.75
RAB11B-202ENST00000594216 ARAP1Q96P48 1450 aa25.98■■□□□ 1.75
RAB11B-202ENST00000594216 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.88■■□□□ 1.73
RAB11B-202ENST00000594216 JPH4Q96JJ6 628 aa25.88■■□□□ 1.73
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