Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL3Q13618 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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