RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369031.4

PDSS2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS2, Length 1,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2-201ENST00000369031 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.81■■■■□ 3.8
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.48■■■■□ 3.11
PDSS2-201ENST00000369031 ABCC9O60706 1549 aa33.54■■■□□ 2.96
PDSS2-201ENST00000369031 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
PDSS2-201ENST00000369031 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.31■■■□□ 2.76
PDSS2-201ENST00000369031 NACADO15069 1562 aa32.29■■■□□ 2.76
PDSS2-201ENST00000369031 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.28■■■□□ 2.76
PDSS2-201ENST00000369031 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.11■■■□□ 2.73
PDSS2-201ENST00000369031 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.07■■■□□ 2.72
PDSS2-201ENST00000369031 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.72■■■□□ 2.67
PDSS2-201ENST00000369031 SCRIBQ14160 1630 aa31.53■■■□□ 2.64
PDSS2-201ENST00000369031 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.39■■■□□ 2.61
PDSS2-201ENST00000369031 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.32■■■□□ 2.6
PDSS2-201ENST00000369031 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.95■■■□□ 2.55
PDSS2-201ENST00000369031 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.55■■■□□ 2.48
PDSS2-201ENST00000369031 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
PDSS2-201ENST00000369031 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.36■■■□□ 2.45
PDSS2-201ENST00000369031 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.25■■■□□ 2.43
PDSS2-201ENST00000369031 SMARCA4P51532 1647 aa30.13■■■□□ 2.41
PDSS2-201ENST00000369031 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
PDSS2-201ENST00000369031 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.96■■■□□ 2.39
PDSS2-201ENST00000369031 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.85■■■□□ 2.37
PDSS2-201ENST00000369031 SMARCA2P51531 1590 aa29.83■■■□□ 2.37
PDSS2-201ENST00000369031 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.77■■■□□ 2.36
PDSS2-201ENST00000369031 NCAPD3P42695 1498 aa29.75■■■□□ 2.35
PDSS2-201ENST00000369031 HMGXB3Q12766 1538 aa29.71■■■□□ 2.35
PDSS2-201ENST00000369031 WIZO95785 1651 aa29.69■■■□□ 2.34
PDSS2-201ENST00000369031 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
PDSS2-201ENST00000369031 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
PDSS2-201ENST00000369031 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PDSS2-201ENST00000369031 NESP48681 1621 aa29.11■■■□□ 2.25
PDSS2-201ENST00000369031 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PDSS2-201ENST00000369031 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29■■■□□ 2.23
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.95■■■□□ 2.22
PDSS2-201ENST00000369031 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.89■■■□□ 2.22
PDSS2-201ENST00000369031 ERCC6Q03468 1493 aa28.86■■■□□ 2.21
PDSS2-201ENST00000369031 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.83■■■□□ 2.21
PDSS2-201ENST00000369031 CFTRP13569 1480 aa28.8■■■□□ 2.2
PDSS2-201ENST00000369031 PRDM2Q13029 1718 aa28.74■■■□□ 2.19
PDSS2-201ENST00000369031 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.73■■■□□ 2.19
PDSS2-201ENST00000369031 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
PDSS2-201ENST00000369031 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.63■■■□□ 2.17
PDSS2-201ENST00000369031 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.59■■■□□ 2.17
PDSS2-201ENST00000369031 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.51■■■□□ 2.15
PDSS2-201ENST00000369031 CUX2O14529 1486 aa28.46■■■□□ 2.15
PDSS2-201ENST00000369031 WDR62O43379 1518 aa28.43■■■□□ 2.14
PDSS2-201ENST00000369031 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PDSS2-201ENST00000369031 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS2-201ENST00000369031 TOPBP1Q92547 1522 aa28.21■■■□□ 2.11
PDSS2-201ENST00000369031 ABCC8Q09428 1581 aa28.11■■■□□ 2.09
PDSS2-201ENST00000369031 CUX1P39880 1505 aa28.1■■■□□ 2.09
PDSS2-201ENST00000369031 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
PDSS2-201ENST00000369031 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.96■■■□□ 2.07
PDSS2-201ENST00000369031 IFT140Q96RY7 1462 aa27.95■■■□□ 2.06
PDSS2-201ENST00000369031 SYNJ1O43426 1573 aa27.94■■■□□ 2.06
PDSS2-201ENST00000369031 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
PDSS2-201ENST00000369031 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PDSS2-201ENST00000369031 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.92■■■□□ 2.06
PDSS2-201ENST00000369031 TOP2BQ02880 1626 aa27.89■■■□□ 2.06
PDSS2-201ENST00000369031 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.88■■■□□ 2.05
PDSS2-201ENST00000369031 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PDSS2-201ENST00000369031 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
PDSS2-201ENST00000369031 SOGA1O94964 1423 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS2-201ENST00000369031 WDR97A6NE52 1622 aa27.81■■■□□ 2.04
PDSS2-201ENST00000369031 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
PDSS2-201ENST00000369031 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
PDSS2-201ENST00000369031 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.66■■■□□ 2.02
PDSS2-201ENST00000369031 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.61■■■□□ 2.01
PDSS2-201ENST00000369031 PBRM1Q86U86 1689 aa27.59■■■□□ 2.01
PDSS2-201ENST00000369031 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.52■■■□□ 2
PDSS2-201ENST00000369031 GRIN2BQ13224 1484 aa27.49■■□□□ 1.99
PDSS2-201ENST00000369031 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.49■■□□□ 1.99
PDSS2-201ENST00000369031 CHD1O14646 1710 aa27.46■■□□□ 1.99
PDSS2-201ENST00000369031 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PDSS2-201ENST00000369031 ADAMTS12P58397 1594 aa27.35■■□□□ 1.97
PDSS2-201ENST00000369031 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.32■■□□□ 1.96
PDSS2-201ENST00000369031 TRIM41Q8WV44 630 aa27.32■■□□□ 1.96
PDSS2-201ENST00000369031 KIF27Q86VH2 1401 aa27.3■■□□□ 1.96
PDSS2-201ENST00000369031 SYNJ2O15056 1496 aa27.29■■□□□ 1.96
PDSS2-201ENST00000369031 FBLN2P98095 1184 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS2-201ENST00000369031 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.28■■□□□ 1.96
PDSS2-201ENST00000369031 OSCARQ8IYS5 282 aa27.22■■□□□ 1.95
PDSS2-201ENST00000369031 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.21■■□□□ 1.95
PDSS2-201ENST00000369031 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.19■■□□□ 1.94
PDSS2-201ENST00000369031 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PDSS2-201ENST00000369031 GRIN2AQ12879 1464 aa27.17■■□□□ 1.94
PDSS2-201ENST00000369031 CUL7Q14999 1698 aa27.17■■□□□ 1.94
PDSS2-201ENST00000369031 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.15■■□□□ 1.94
PDSS2-201ENST00000369031 IGF1RP08069 1367 aa27.14■■□□□ 1.94
PDSS2-201ENST00000369031 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.1■■□□□ 1.93
PDSS2-201ENST00000369031 CEP170Q5SW79 1584 aa27.09■■□□□ 1.93
PDSS2-201ENST00000369031 NUP160Q12769 1436 aa27.01■■□□□ 1.91
PDSS2-201ENST00000369031 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.99■■□□□ 1.91
PDSS2-201ENST00000369031 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.95■■□□□ 1.91
PDSS2-201ENST00000369031 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.95■■□□□ 1.91
PDSS2-201ENST00000369031 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.95■■□□□ 1.91
PDSS2-201ENST00000369031 ARHGEF11O15085 1522 aa26.93■■□□□ 1.9
PDSS2-201ENST00000369031 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.88■■□□□ 1.89
PDSS2-201ENST00000369031 EEA1Q15075 1411 aa26.87■■□□□ 1.89
PDSS2-201ENST00000369031 SHROOM2Q13796 1616 aa26.85■■□□□ 1.89
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