Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TCHP-204ENST00000537218 853 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ATG3-206ENST00000492886 639 ntTSL 313.93□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-8■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SAFB-214ENST00000592707 940 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF451-206ENST00000370711 609 ntTSL 413.14□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF451-207ENST00000444273 3402 ntTSL 1 (best)13.13□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 EPB41L2-225ENST00000530707 565 ntTSL 412.49□□□□□ -0.411e-8■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ATG3-209ENST00000496423 737 ntTSL 511.91□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.532e-7■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 EPB41L2-203ENST00000368128 4456 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 21.3
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TRA2AQ13595 TCHP-202ENST00000405876 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 CLIP1-203ENST00000361654 5568 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.793e-12■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-7■■■■□ 21.3
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TRA2AQ13595 TCHP-201ENST00000312777 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 CLIP1-213ENST00000540338 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-12■■■■□ 21.3
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TRA2AQ13595 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.893e-12■■■■□ 21.3
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TRA2AQ13595 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.922e-7■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.943e-8■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.943e-12■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-12■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 TCHP-203ENST00000536408 973 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 MPHOSPH8-202ENST00000414242 1048 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21.3
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TRA2AQ13595 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.033e-8■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.052e-6■■■■□ 21.3
TRA2AQ13595 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.989e-8■■■■□ 21.2
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TRA2AQ13595 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.019e-8■■■■□ 21.2
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TRA2AQ13595 CALM2-205ENST00000460218 4502 ntTSL 1 (best)1.83□□□□□ -2.122e-7■■■■□ 21.2
TRA2AQ13595 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 21.2
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TRA2AQ13595 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-7■■■■□ 21.1
TRA2AQ13595 CEP85-208ENST00000491670 941 ntTSL 27.37□□□□□ -1.239e-8■■■■□ 21.1
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TRA2AQ13595 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21.1
TRA2AQ13595 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 21.1
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TRA2AQ13595 SRSF11-216ENST00000489188 784 ntTSL 23.6□□□□□ -1.833e-11■■■■□ 21
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TRA2AQ13595 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 28.24□□□□□ -1.092e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.42e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.512e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-207ENST00000537965 578 ntTSL 55.34□□□□□ -1.552e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.572e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.592e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.642e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-214ENST00000540865 784 ntTSL 54.65□□□□□ -1.672e-56■■■■□ 20.9
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TRA2AQ13595 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.752e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.782e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.792e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-222ENST00000545308 646 ntTSL 23.77□□□□□ -1.812e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-224ENST00000545688 610 ntTSL 33.67□□□□□ -1.822e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-203ENST00000537024 532 ntTSL 53.65□□□□□ -1.832e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.952e-56■■■■□ 20.9
TRA2AQ13595 SNHG1-202ENST00000535689 550 ntTSL 22.86□□□□□ -1.952e-56■■■■□ 20.9
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