Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RDXP35241 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDXP35241 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDXP35241 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RDXP35241 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDXP35241 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RDXP35241 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RDXP35241 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDXP35241 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDXP35241 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDXP35241 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDXP35241 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDXP35241 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDXP35241 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RDXP35241 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RDXP35241 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RDXP35241 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RDXP35241 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RDXP35241 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RDXP35241 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RDXP35241 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDXP35241 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDXP35241 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDXP35241 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDXP35241 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDXP35241 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDXP35241 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDXP35241 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RDXP35241 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RDXP35241 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDXP35241 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDXP35241 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDXP35241 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDXP35241 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDXP35241 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RDXP35241 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RDXP35241 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RDXP35241 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RDXP35241 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RDXP35241 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RDXP35241 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RDXP35241 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RDXP35241 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDXP35241 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDXP35241 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDXP35241 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RDXP35241 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RDXP35241 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms