Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATG16L1Q676U5 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms