Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CIPCQ9C0C6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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