Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LACTB2Q53H82 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms