RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343131.6

SYCE1-202, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYCE1, Length 1,113 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-202ENST00000343131 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.8■■■■□ 3.96
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.78■■■■□ 3.32
SYCE1-202ENST00000343131 ABCC9O60706 1549 aa35.54■■■■□ 3.28
SYCE1-202ENST00000343131 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.89■■■■□ 3.02
SYCE1-202ENST00000343131 NACADO15069 1562 aa33.66■■■□□ 2.98
SYCE1-202ENST00000343131 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.38■■■□□ 2.93
SYCE1-202ENST00000343131 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.33■■■□□ 2.93
SYCE1-202ENST00000343131 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.2■■■□□ 2.91
SYCE1-202ENST00000343131 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.08■■■□□ 2.89
SYCE1-202ENST00000343131 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
SYCE1-202ENST00000343131 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
SYCE1-202ENST00000343131 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.96■■■□□ 2.87
SYCE1-202ENST00000343131 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.86■■■□□ 2.85
SYCE1-202ENST00000343131 SCRIBQ14160 1630 aa32.63■■■□□ 2.81
SYCE1-202ENST00000343131 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.43■■■□□ 2.78
SYCE1-202ENST00000343131 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.16■■■□□ 2.74
SYCE1-202ENST00000343131 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
SYCE1-202ENST00000343131 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.97■■■□□ 2.71
SYCE1-202ENST00000343131 SMARCA4P51532 1647 aa31.11■■■□□ 2.57
SYCE1-202ENST00000343131 NCAPD3P42695 1498 aa31.01■■■□□ 2.55
SYCE1-202ENST00000343131 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.98■■■□□ 2.55
SYCE1-202ENST00000343131 SMARCA2P51531 1590 aa30.94■■■□□ 2.54
SYCE1-202ENST00000343131 HMGXB3Q12766 1538 aa30.91■■■□□ 2.54
SYCE1-202ENST00000343131 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
SYCE1-202ENST00000343131 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.75■■■□□ 2.51
SYCE1-202ENST00000343131 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
SYCE1-202ENST00000343131 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.71■■■□□ 2.51
SYCE1-202ENST00000343131 ERCC6Q03468 1493 aa30.65■■■□□ 2.5
SYCE1-202ENST00000343131 NESP48681 1621 aa30.6■■■□□ 2.49
SYCE1-202ENST00000343131 CUX2O14529 1486 aa30.52■■■□□ 2.48
SYCE1-202ENST00000343131 WIZO95785 1651 aa30.42■■■□□ 2.46
SYCE1-202ENST00000343131 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.39■■■□□ 2.46
SYCE1-202ENST00000343131 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SYCE1-202ENST00000343131 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.34■■■□□ 2.45
SYCE1-202ENST00000343131 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.19■■■□□ 2.42
SYCE1-202ENST00000343131 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.09■■■□□ 2.41
SYCE1-202ENST00000343131 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
SYCE1-202ENST00000343131 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.04■■■□□ 2.4
SYCE1-202ENST00000343131 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
SYCE1-202ENST00000343131 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.93■■■□□ 2.38
SYCE1-202ENST00000343131 WDR62O43379 1518 aa29.89■■■□□ 2.38
SYCE1-202ENST00000343131 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.84■■■□□ 2.37
SYCE1-202ENST00000343131 CFTRP13569 1480 aa29.8■■■□□ 2.36
SYCE1-202ENST00000343131 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.8■■■□□ 2.36
SYCE1-202ENST00000343131 PRDM2Q13029 1718 aa29.77■■■□□ 2.36
SYCE1-202ENST00000343131 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SYCE1-202ENST00000343131 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.57■■■□□ 2.32
SYCE1-202ENST00000343131 TOPBP1Q92547 1522 aa29.27■■■□□ 2.28
SYCE1-202ENST00000343131 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.22■■■□□ 2.27
SYCE1-202ENST00000343131 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
SYCE1-202ENST00000343131 IFT140Q96RY7 1462 aa29.18■■■□□ 2.26
SYCE1-202ENST00000343131 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
SYCE1-202ENST00000343131 ABCC8Q09428 1581 aa29.11■■■□□ 2.25
SYCE1-202ENST00000343131 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
SYCE1-202ENST00000343131 TRIM41Q8WV44 630 aa29.03■■■□□ 2.24
SYCE1-202ENST00000343131 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SYCE1-202ENST00000343131 OSCARQ8IYS5 282 aa28.99■■■□□ 2.23
SYCE1-202ENST00000343131 CHD1O14646 1710 aa28.94■■■□□ 2.22
SYCE1-202ENST00000343131 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
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SYCE1-202ENST00000343131 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.87■■■□□ 2.21
SYCE1-202ENST00000343131 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.87■■■□□ 2.21
SYCE1-202ENST00000343131 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.86■■■□□ 2.21
SYCE1-202ENST00000343131 CUX1P39880 1505 aa28.86■■■□□ 2.21
SYCE1-202ENST00000343131 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.85■■■□□ 2.21
SYCE1-202ENST00000343131 WDR97A6NE52 1622 aa28.77■■■□□ 2.2
SYCE1-202ENST00000343131 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SYCE1-202ENST00000343131 SOGA1O94964 1423 aa28.76■■■□□ 2.19
SYCE1-202ENST00000343131 ARHGEF11O15085 1522 aa28.74■■■□□ 2.19
SYCE1-202ENST00000343131 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SYCE1-202ENST00000343131 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.66■■■□□ 2.18
SYCE1-202ENST00000343131 PBRM1Q86U86 1689 aa28.65■■■□□ 2.18
SYCE1-202ENST00000343131 FBLN2P98095 1184 aa28.59■■■□□ 2.17
SYCE1-202ENST00000343131 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
SYCE1-202ENST00000343131 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.54■■■□□ 2.16
SYCE1-202ENST00000343131 GRIN2BQ13224 1484 aa28.54■■■□□ 2.16
SYCE1-202ENST00000343131 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.51■■■□□ 2.15
SYCE1-202ENST00000343131 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.5■■■□□ 2.15
SYCE1-202ENST00000343131 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.48■■■□□ 2.15
SYCE1-202ENST00000343131 ARAP1Q96P48 1450 aa28.47■■■□□ 2.15
SYCE1-202ENST00000343131 SYNJ1O43426 1573 aa28.47■■■□□ 2.15
SYCE1-202ENST00000343131 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.46■■■□□ 2.15
SYCE1-202ENST00000343131 TOP2BQ02880 1626 aa28.45■■■□□ 2.14
SYCE1-202ENST00000343131 SYNJ2O15056 1496 aa28.45■■■□□ 2.14
SYCE1-202ENST00000343131 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
SYCE1-202ENST00000343131 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.36■■■□□ 2.13
SYCE1-202ENST00000343131 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
SYCE1-202ENST00000343131 ADAMTS12P58397 1594 aa28.33■■■□□ 2.12
SYCE1-202ENST00000343131 GRIN2AQ12879 1464 aa28.22■■■□□ 2.11
SYCE1-202ENST00000343131 CEP170Q5SW79 1584 aa28.19■■■□□ 2.1
SYCE1-202ENST00000343131 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.13■■■□□ 2.09
SYCE1-202ENST00000343131 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.11■■■□□ 2.09
SYCE1-202ENST00000343131 NUP160Q12769 1436 aa28.09■■■□□ 2.09
SYCE1-202ENST00000343131 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.08■■■□□ 2.09
SYCE1-202ENST00000343131 SHROOM2Q13796 1616 aa28.05■■■□□ 2.08
SYCE1-202ENST00000343131 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
SYCE1-202ENST00000343131 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.95■■■□□ 2.06
SYCE1-202ENST00000343131 CUL7Q14999 1698 aa27.84■■■□□ 2.05
SYCE1-202ENST00000343131 KIF27Q86VH2 1401 aa27.77■■■□□ 2.04
SYCE1-202ENST00000343131 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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