Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PKM-224ENST00000569857 1355 ntTSL 514.6□□□□□ -0.078e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-205ENST00000556310 626 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-206ENST00000556375 408 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-212ENST00000613856 420 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.323e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.388e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PKM-221ENST00000568743 580 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.518e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-204ENST00000555890 471 ntTSL 27.49□□□□□ -1.213e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-202ENST00000553981 285 ntTSL 33.82□□□□□ -1.83e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-208ENST00000556956 450 ntTSL 22.97□□□□□ -1.933e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-206ENST00000587730 1813 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-208ENST00000588692 1478 ntTSL 517.46■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-209ENST00000589318 1903 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-202ENST00000324340 1355 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 C19orf25-209ENST00000590621 885 ntTSL 316.56■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.657e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TIMM44-208ENST00000598968 797 ntTSL 327■■□□□ 1.917e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NABP2-206ENST00000479016 1031 ntTSL 226.86■■□□□ 1.897e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 C2orf68-204ENST00000423181 976 ntTSL 1 (best)26.25■■□□□ 1.791e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TMC6-213ENST00000589933 580 ntTSL 325.81■■□□□ 1.727e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.587e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.487e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.443e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 RFXANK-210ENST00000541873 1002 ntTSL 223.95■■□□□ 1.423e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.391e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.297e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.237e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHID1-218ENST00000531010 408 ntTSL 222.73■■□□□ 1.237e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)22.67■■□□□ 1.227e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.27e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 RFXANK-209ENST00000540981 832 ntTSL 522.51■■□□□ 1.193e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-208ENST00000530887 891 ntTSL 222.45■■□□□ 1.187e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.143e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.131e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HERC2-210ENST00000568206 2018 ntTSL 221.46■■□□□ 1.031e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.997e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 WDR18-206ENST00000590397 1083 ntTSL 521.24■□□□□ 0.997e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.987e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NABP2-204ENST00000399713 663 ntTSL 520.88■□□□□ 0.937e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-205ENST00000416258 2188 ntTSL 520.85■□□□□ 0.937e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.927e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 220.67■□□□□ 0.97e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.897e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.877e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.777e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.777e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 519.83■□□□□ 0.773e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PDLIM7-213ENST00000505074 931 ntTSL 319.8■□□□□ 0.763e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ARPC4-207ENST00000485273 577 ntTSL 219.76■□□□□ 0.753e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ERCC2-202ENST00000391942 1488 ntTSL 219.73■□□□□ 0.757e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ERCC2-201ENST00000391941 2871 ntTSL 1 (best)19.69■□□□□ 0.747e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-213ENST00000467661 1707 ntTSL 1 (best)19.47■□□□□ 0.717e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 COPE-206ENST00000597026 678 ntTSL 219.44■□□□□ 0.77e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ERCC2-211ENST00000588652 2405 ntTSL 219.39■□□□□ 0.697e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.671e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ARL8B-205ENST00000455168 1641 ntTSL 218.95■□□□□ 0.623e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 C2orf68-203ENST00000420686 1204 ntTSL 218.89■□□□□ 0.611e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.597e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.577e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.547e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-212ENST00000463820 2495 ntTSL 218.35■□□□□ 0.537e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 WDR18-208ENST00000591276 607 ntTSL 318.35■□□□□ 0.537e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PPP2R1A-203ENST00000454220 1233 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.537e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HGS-202ENST00000570355 735 ntTSL 518.2■□□□□ 0.57e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.487e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PPP2R1A-210ENST00000490868 668 ntTSL 217.89■□□□□ 0.457e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-202ENST00000524447 935 ntTSL 317.83■□□□□ 0.447e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.447e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HSF1-211ENST00000533130 493 ntTSL 317.57■□□□□ 0.47e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.377e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MARK3-209ENST00000555235 2282 ntTSL 217.23■□□□□ 0.357e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AC002985.1-202ENST00000593484 584 ntAPPRIS P1 TSL 516.98■□□□□ 0.317e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.37e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.277e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.247e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.27e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.23e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-207ENST00000559171 508 ntTSL 316.21■□□□□ 0.197e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.177e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.167e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.167e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HSF1-213ENST00000534314 684 ntTSL 215.98■□□□□ 0.157e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.147e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.137e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 515.66■□□□□ 0.17e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-207ENST00000530651 905 ntTSL 515.62■□□□□ 0.097e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TLN1-207ENST00000489255 798 ntTSL 215.44■□□□□ 0.067e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.037e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PPP2R1A-206ENST00000468280 688 ntTSL 215.08■□□□□ 07e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-210ENST00000531051 777 ntTSL 515.07■□□□□ 07e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-210ENST00000416671 2560 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.027e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.067e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HGS-213ENST00000575078 330 ntTSL 314.3□□□□□ -0.127e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.137e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SETD3-205ENST00000446066 1754 ntTSL 514.13□□□□□ -0.157e-6■□□□□ 8.5
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