RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541873.6

RFXANK-210, Transcript of regulatory factor X associated ankyrin containing protein, humanhuman

TSL 2

Gene RFXANK, Length 1,002 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANK-210ENST00000541873 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.12■■■■■ 5.45
RFXANK-210ENST00000541873 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.89■■■■■ 4.62
RFXANK-210ENST00000541873 ABCC9O60706 1549 aa43.76■■■■■ 4.6
RFXANK-210ENST00000541873 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.71■■■■■ 4.27
RFXANK-210ENST00000541873 NACADO15069 1562 aa41.5■■■■■ 4.23
RFXANK-210ENST00000541873 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.33■■■■■ 4.21
RFXANK-210ENST00000541873 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.06■■■■■ 4.16
RFXANK-210ENST00000541873 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.96■■■■■ 4.15
RFXANK-210ENST00000541873 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.82■■■■■ 4.13
RFXANK-210ENST00000541873 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
RFXANK-210ENST00000541873 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.68■■■■■ 4.1
RFXANK-210ENST00000541873 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.6■■■■■ 4.09
RFXANK-210ENST00000541873 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.54■■■■■ 4.08
RFXANK-210ENST00000541873 SCRIBQ14160 1630 aa40.02■■■■■ 4
RFXANK-210ENST00000541873 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.01■■■■■ 4
RFXANK-210ENST00000541873 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.51■■■■□ 3.92
RFXANK-210ENST00000541873 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.5■■■■□ 3.91
RFXANK-210ENST00000541873 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.41■■■■□ 3.9
RFXANK-210ENST00000541873 NCAPD3P42695 1498 aa38.37■■■■□ 3.73
RFXANK-210ENST00000541873 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.28■■■■□ 3.72
RFXANK-210ENST00000541873 SMARCA4P51532 1647 aa38.23■■■■□ 3.71
RFXANK-210ENST00000541873 SMARCA2P51531 1590 aa38.13■■■■□ 3.69
RFXANK-210ENST00000541873 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
RFXANK-210ENST00000541873 HMGXB3Q12766 1538 aa38.05■■■■□ 3.68
RFXANK-210ENST00000541873 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.89■■■■□ 3.66
RFXANK-210ENST00000541873 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.86■■■■□ 3.65
RFXANK-210ENST00000541873 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
RFXANK-210ENST00000541873 ERCC6Q03468 1493 aa37.73■■■■□ 3.63
RFXANK-210ENST00000541873 NESP48681 1621 aa37.67■■■■□ 3.62
RFXANK-210ENST00000541873 CUX2O14529 1486 aa37.63■■■■□ 3.61
RFXANK-210ENST00000541873 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.43■■■■□ 3.58
RFXANK-210ENST00000541873 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.4■■■■□ 3.58
RFXANK-210ENST00000541873 WIZO95785 1651 aa37.35■■■■□ 3.57
RFXANK-210ENST00000541873 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.21■■■■□ 3.55
RFXANK-210ENST00000541873 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.21■■■■□ 3.55
RFXANK-210ENST00000541873 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
RFXANK-210ENST00000541873 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
RFXANK-210ENST00000541873 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.09■■■■□ 3.53
RFXANK-210ENST00000541873 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
RFXANK-210ENST00000541873 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.87■■■■□ 3.49
RFXANK-210ENST00000541873 CFTRP13569 1480 aa36.83■■■■□ 3.49
RFXANK-210ENST00000541873 WDR62O43379 1518 aa36.77■■■■□ 3.48
RFXANK-210ENST00000541873 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.75■■■■□ 3.47
RFXANK-210ENST00000541873 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.75■■■■□ 3.47
RFXANK-210ENST00000541873 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.54■■■■□ 3.44
RFXANK-210ENST00000541873 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
RFXANK-210ENST00000541873 PRDM2Q13029 1718 aa36.28■■■■□ 3.4
RFXANK-210ENST00000541873 TOPBP1Q92547 1522 aa36.08■■■■□ 3.37
RFXANK-210ENST00000541873 IFT140Q96RY7 1462 aa36.04■■■■□ 3.36
RFXANK-210ENST00000541873 ABCC8Q09428 1581 aa36■■■■□ 3.35
RFXANK-210ENST00000541873 OSCARQ8IYS5 282 aa35.98■■■■□ 3.35
RFXANK-210ENST00000541873 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
RFXANK-210ENST00000541873 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.94■■■■□ 3.34
RFXANK-210ENST00000541873 TRIM41Q8WV44 630 aa35.8■■■■□ 3.32
RFXANK-210ENST00000541873 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
RFXANK-210ENST00000541873 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
RFXANK-210ENST00000541873 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
RFXANK-210ENST00000541873 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.35e-7■■■■■ 34
RFXANK-210ENST00000541873 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
RFXANK-210ENST00000541873 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.6■■■■□ 3.29
RFXANK-210ENST00000541873 SOGA1O94964 1423 aa35.58■■■■□ 3.29
RFXANK-210ENST00000541873 CUX1P39880 1505 aa35.54■■■■□ 3.28
RFXANK-210ENST00000541873 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.53■■■■□ 3.28
RFXANK-210ENST00000541873 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
RFXANK-210ENST00000541873 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.42■■■■□ 3.26
RFXANK-210ENST00000541873 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.42■■■■□ 3.26
RFXANK-210ENST00000541873 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.42■■■■□ 3.26
RFXANK-210ENST00000541873 ARHGEF11O15085 1522 aa35.37■■■■□ 3.25
RFXANK-210ENST00000541873 FBLN2P98095 1184 aa35.36■■■■□ 3.25
RFXANK-210ENST00000541873 WDR97A6NE52 1622 aa35.35■■■■□ 3.25
RFXANK-210ENST00000541873 CHD1O14646 1710 aa35.35■■■■□ 3.25
RFXANK-210ENST00000541873 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.29■■■■□ 3.24
RFXANK-210ENST00000541873 GRIN2BQ13224 1484 aa35.24■■■■□ 3.23
RFXANK-210ENST00000541873 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
RFXANK-210ENST00000541873 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.16■■■■□ 3.22
RFXANK-210ENST00000541873 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
RFXANK-210ENST00000541873 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.14■■■■□ 3.22
RFXANK-210ENST00000541873 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.12■■■■□ 3.21
RFXANK-210ENST00000541873 SYNJ2O15056 1496 aa35.09■■■■□ 3.21
RFXANK-210ENST00000541873 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.06■■■■□ 3.2
RFXANK-210ENST00000541873 ARAP1Q96P48 1450 aa35.06■■■■□ 3.2
RFXANK-210ENST00000541873 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.06■■■■□ 3.2
RFXANK-210ENST00000541873 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.05■■■■□ 3.2
RFXANK-210ENST00000541873 SYNJ1O43426 1573 aa35.01■■■■□ 3.2
RFXANK-210ENST00000541873 TOP2BQ02880 1626 aa35■■■■□ 3.19
RFXANK-210ENST00000541873 PBRM1Q86U86 1689 aa35■■■■□ 3.19
RFXANK-210ENST00000541873 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.97■■■■□ 3.19
RFXANK-210ENST00000541873 GRIN2AQ12879 1464 aa34.78■■■■□ 3.16
RFXANK-210ENST00000541873 ADAMTS12P58397 1594 aa34.76■■■■□ 3.16
RFXANK-210ENST00000541873 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.72■■■■□ 3.15
RFXANK-210ENST00000541873 NUP160Q12769 1436 aa34.7■■■■□ 3.15
RFXANK-210ENST00000541873 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.7■■■■□ 3.14
RFXANK-210ENST00000541873 CEP170Q5SW79 1584 aa34.64■■■■□ 3.14
RFXANK-210ENST00000541873 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
RFXANK-210ENST00000541873 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.53■■■■□ 3.12
RFXANK-210ENST00000541873 SHROOM2Q13796 1616 aa34.46■■■■□ 3.11
RFXANK-210ENST00000541873 IGF1RP08069 1367 aa34.37■■■■□ 3.09
RFXANK-210ENST00000541873 JPH4Q96JJ6 628 aa34.35■■■■□ 3.09
RFXANK-210ENST00000541873 KIF27Q86VH2 1401 aa34.35■■■■□ 3.09
RFXANK-210ENST00000541873 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
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