Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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CSTF3Q12996 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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