Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CSTF3Q12996 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CSTF3Q12996 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CSTF3Q12996 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CSTF3Q12996 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CSTF3Q12996 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CSTF3Q12996 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CSTF3Q12996 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CSTF3Q12996 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CSTF3Q12996 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CSTF3Q12996 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CSTF3Q12996 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CSTF3Q12996 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CSTF3Q12996 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CSTF3Q12996 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSTF3Q12996 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSTF3Q12996 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSTF3Q12996 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSTF3Q12996 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CSTF3Q12996 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CSTF3Q12996 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CSTF3Q12996 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CSTF3Q12996 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CSTF3Q12996 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CSTF3Q12996 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CSTF3Q12996 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSTF3Q12996 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSTF3Q12996 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSTF3Q12996 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSTF3Q12996 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSTF3Q12996 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSTF3Q12996 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSTF3Q12996 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSTF3Q12996 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSTF3Q12996 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CSTF3Q12996 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSTF3Q12996 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSTF3Q12996 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSTF3Q12996 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSTF3Q12996 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSTF3Q12996 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CSTF3Q12996 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CSTF3Q12996 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CSTF3Q12996 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CSTF3Q12996 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSTF3Q12996 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSTF3Q12996 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSTF3Q12996 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CSTF3Q12996 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSTF3Q12996 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSTF3Q12996 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSTF3Q12996 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CSTF3Q12996 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSTF3Q12996 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSTF3Q12996 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSTF3Q12996 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSTF3Q12996 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSTF3Q12996 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSTF3Q12996 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSTF3Q12996 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSTF3Q12996 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSTF3Q12996 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSTF3Q12996 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSTF3Q12996 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSTF3Q12996 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSTF3Q12996 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSTF3Q12996 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSTF3Q12996 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSTF3Q12996 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSTF3Q12996 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSTF3Q12996 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSTF3Q12996 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSTF3Q12996 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSTF3Q12996 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSTF3Q12996 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSTF3Q12996 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSTF3Q12996 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSTF3Q12996 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSTF3Q12996 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CSTF3Q12996 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSTF3Q12996 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSTF3Q12996 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSTF3Q12996 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSTF3Q12996 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSTF3Q12996 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSTF3Q12996 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSTF3Q12996 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSTF3Q12996 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSTF3Q12996 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSTF3Q12996 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSTF3Q12996 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSTF3Q12996 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSTF3Q12996 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSTF3Q12996 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSTF3Q12996 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSTF3Q12996 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSTF3Q12996 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSTF3Q12996 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSTF3Q12996 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSTF3Q12996 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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