RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355377.6

SYT17-201, Transcript of synaptotagmin 17, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT17, Length 3,081 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17-201ENST00000355377 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.84■■■□□ 2.21
SYT17-201ENST00000355377 HRCP23327 699 aa25.89■■□□□ 1.74
SYT17-201ENST00000355377 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SYT17-201ENST00000355377 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.49■■□□□ 1.67
SYT17-201ENST00000355377 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SYT17-201ENST00000355377 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SYT17-201ENST00000355377 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.26■■□□□ 1.63
SYT17-201ENST00000355377 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.88■■□□□ 1.57
SYT17-201ENST00000355377 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SYT17-201ENST00000355377 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.7■■□□□ 1.55
SYT17-201ENST00000355377 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SYT17-201ENST00000355377 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.4■■□□□ 1.5
SYT17-201ENST00000355377 MYT1Q01538 1121 aa24.36■■□□□ 1.49
SYT17-201ENST00000355377 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SYT17-201ENST00000355377 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT17-201ENST00000355377 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT17-201ENST00000355377 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SYT17-201ENST00000355377 NEUROD1Q13562 356 aa24.02■■□□□ 1.44
SYT17-201ENST00000355377 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SYT17-201ENST00000355377 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.97■■□□□ 1.43
SYT17-201ENST00000355377 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.78■■□□□ 1.4
SYT17-201ENST00000355377 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SYT17-201ENST00000355377 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.66■■□□□ 1.38
SYT17-201ENST00000355377 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SYT17-201ENST00000355377 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SYT17-201ENST00000355377 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SYT17-201ENST00000355377 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SYT17-201ENST00000355377 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SYT17-201ENST00000355377 TRIM41Q8WV44 630 aa23.22■■□□□ 1.31
SYT17-201ENST00000355377 ABCC9O60706 1549 aa23.18■■□□□ 1.3
SYT17-201ENST00000355377 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SYT17-201ENST00000355377 BCL11AQ9H165 835 aa23.02■■□□□ 1.28
SYT17-201ENST00000355377 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SYT17-201ENST00000355377 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SYT17-201ENST00000355377 MIER1Q8N108 512 aa22.91■■□□□ 1.26
SYT17-201ENST00000355377 SCRIBQ14160 1630 aa22.86■■□□□ 1.25
SYT17-201ENST00000355377 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.81■■□□□ 1.24
SYT17-201ENST00000355377 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.79■■□□□ 1.24
SYT17-201ENST00000355377 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.65■■□□□ 1.22
SYT17-201ENST00000355377 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYT17-201ENST00000355377 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT17-201ENST00000355377 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.48■■□□□ 1.19
SYT17-201ENST00000355377 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.45■■□□□ 1.18
SYT17-201ENST00000355377 BCANQ96GW7 911 aa22.43■■□□□ 1.18
SYT17-201ENST00000355377 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SYT17-201ENST00000355377 NACADO15069 1562 aa22.37■■□□□ 1.17
SYT17-201ENST00000355377 WIZO95785 1651 aa22.36■■□□□ 1.17
SYT17-201ENST00000355377 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.3■■□□□ 1.16
SYT17-201ENST00000355377 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SYT17-201ENST00000355377 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYT17-201ENST00000355377 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SYT17-201ENST00000355377 FKBP8Q14318 412 aa22.12■■□□□ 1.13
SYT17-201ENST00000355377 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYT17-201ENST00000355377 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SYT17-201ENST00000355377 CEP162Q5TB80 1403 aa22.1■■□□□ 1.13
SYT17-201ENST00000355377 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYT17-201ENST00000355377 ITGAEP38570 1179 aa22.03■■□□□ 1.12
SYT17-201ENST00000355377 KCNH8Q96L42 1107 aa22.03■■□□□ 1.12
SYT17-201ENST00000355377 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.01■■□□□ 1.11
SYT17-201ENST00000355377 ABCC8Q09428 1581 aa22.01■■□□□ 1.11
SYT17-201ENST00000355377 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SYT17-201ENST00000355377 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.95■■□□□ 1.11
SYT17-201ENST00000355377 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.94■■□□□ 1.1
SYT17-201ENST00000355377 NEFLP07196 543 aa21.92■■□□□ 1.1
SYT17-201ENST00000355377 SMARCA2P51531 1590 aa21.9■■□□□ 1.1
SYT17-201ENST00000355377 SOGA1O94964 1423 aa21.9■■□□□ 1.1
SYT17-201ENST00000355377 MSH5O43196 834 aa21.88■■□□□ 1.09
SYT17-201ENST00000355377 SMARCA4P51532 1647 aa21.87■■□□□ 1.09
SYT17-201ENST00000355377 EEA1Q15075 1411 aa21.85■■□□□ 1.09
SYT17-201ENST00000355377 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
SYT17-201ENST00000355377 APLP2Q06481 763 aa21.81■■□□□ 1.08
SYT17-201ENST00000355377 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.77■■□□□ 1.08
SYT17-201ENST00000355377 TRIM52Q96A61 297 aa21.74■■□□□ 1.07
SYT17-201ENST00000355377 GOLGA3Q08378 1498 aa21.72■■□□□ 1.07
SYT17-201ENST00000355377 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SYT17-201ENST00000355377 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SYT17-201ENST00000355377 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
SYT17-201ENST00000355377 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.62■■□□□ 1.05
SYT17-201ENST00000355377 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SYT17-201ENST00000355377 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
SYT17-201ENST00000355377 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SYT17-201ENST00000355377 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.55■■□□□ 1.04
SYT17-201ENST00000355377 NBR1Q14596 966 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT17-201ENST00000355377 KIF21BO75037 1637 aa21.54■■□□□ 1.04
SYT17-201ENST00000355377 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.52■■□□□ 1.04
SYT17-201ENST00000355377 CLIP1P30622 1438 aa21.5■■□□□ 1.03
SYT17-201ENST00000355377 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SYT17-201ENST00000355377 SYNJ1O43426 1573 aa21.47■■□□□ 1.03
SYT17-201ENST00000355377 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.47■■□□□ 1.03
SYT17-201ENST00000355377 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.44■■□□□ 1.02
SYT17-201ENST00000355377 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.42■■□□□ 1.02
SYT17-201ENST00000355377 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SYT17-201ENST00000355377 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.42■■□□□ 1.02
SYT17-201ENST00000355377 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SYT17-201ENST00000355377 ANP32CO43423 234 aa21.36■■□□□ 1.01
SYT17-201ENST00000355377 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYT17-201ENST00000355377 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.34■■□□□ 1.01
SYT17-201ENST00000355377 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.33■■□□□ 1.01
SYT17-201ENST00000355377 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
SYT17-201ENST00000355377 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.1 ms