Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMB4P28070 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMB4P28070 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms