Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLCO1C1Q9NYB5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLCO1C1Q9NYB5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLCO1C1Q9NYB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms