Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHL15Q96M94 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KLHL15Q96M94 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL15Q96M94 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms