Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KLHL15Q96M94 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KLHL15Q96M94 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
KLHL15Q96M94 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
KLHL15Q96M94 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KLHL15Q96M94 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHL15Q96M94 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KLHL15Q96M94 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KLHL15Q96M94 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KLHL15Q96M94 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KLHL15Q96M94 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KLHL15Q96M94 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KLHL15Q96M94 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KLHL15Q96M94 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KLHL15Q96M94 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KLHL15Q96M94 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KLHL15Q96M94 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KLHL15Q96M94 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL15Q96M94 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KLHL15Q96M94 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL15Q96M94 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL15Q96M94 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KLHL15Q96M94 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KLHL15Q96M94 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL15Q96M94 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KLHL15Q96M94 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL15Q96M94 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL15Q96M94 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHL15Q96M94 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL15Q96M94 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KLHL15Q96M94 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL15Q96M94 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL15Q96M94 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL15Q96M94 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL15Q96M94 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL15Q96M94 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL15Q96M94 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL15Q96M94 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL15Q96M94 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KLHL15Q96M94 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KLHL15Q96M94 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KLHL15Q96M94 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHL15Q96M94 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHL15Q96M94 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHL15Q96M94 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHL15Q96M94 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHL15Q96M94 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL15Q96M94 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHL15Q96M94 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHL15Q96M94 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHL15Q96M94 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHL15Q96M94 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHL15Q96M94 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHL15Q96M94 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHL15Q96M94 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHL15Q96M94 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHL15Q96M94 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHL15Q96M94 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL15Q96M94 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL15Q96M94 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL15Q96M94 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL15Q96M94 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL15Q96M94 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL15Q96M94 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL15Q96M94 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL15Q96M94 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL15Q96M94 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL15Q96M94 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL15Q96M94 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL15Q96M94 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL15Q96M94 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KLHL15Q96M94 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL15Q96M94 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KLHL15Q96M94 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL15Q96M94 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KLHL15Q96M94 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL15Q96M94 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL15Q96M94 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL15Q96M94 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL15Q96M94 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL15Q96M94 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL15Q96M94 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL15Q96M94 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL15Q96M94 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL15Q96M94 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL15Q96M94 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL15Q96M94 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL15Q96M94 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL15Q96M94 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KLHL15Q96M94 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KLHL15Q96M94 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KLHL15Q96M94 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KLHL15Q96M94 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL15Q96M94 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KLHL15Q96M94 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KLHL15Q96M94 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KLHL15Q96M94 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KLHL15Q96M94 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL15Q96M94 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHL15Q96M94 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms