Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 28.63□□□□□ -1.032e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.062e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.76□□□□□ -1.172e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.242e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.292e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.332e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.483e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.413e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 513.54□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.283e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 512.94□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 511.19□□□□□ -0.623e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 510.16□□□□□ -0.783e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.783e-6■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-8■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 HSP90AB2P-202ENST00000602906 1277 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-8■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC6.61□□□□□ -1.352e-8■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.174e-7■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.265e-10■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 216.07■□□□□ 0.165e-10■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 APLP2-213ENST00000529701 573 ntTSL 515.98■□□□□ 0.155e-10■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 APLP2-208ENST00000526330 582 ntTSL 315.98■□□□□ 0.155e-10■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-10■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.525e-10■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.685e-10■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.695e-10■■■□□ 17.1
SRSF7Q16629 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-11■■■□□ 17
SRSF7Q16629 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-11■■■□□ 17
SRSF7Q16629 CTDSP2-202ENST00000547169 1340 ntTSL 212.65□□□□□ -0.381e-11■■■□□ 17
SRSF7Q16629 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-11■■■□□ 17
SRSF7Q16629 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.377e-7■■■□□ 17
SRSF7Q16629 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.167e-7■■■□□ 17
SRSF7Q16629 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.17e-11■■■□□ 17
SRSF7Q16629 SH3BP2-220ENST00000511663 966 ntTSL 514.85□□□□□ -0.037e-7■■■□□ 17
SRSF7Q16629 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.037e-11■■■□□ 17
SRSF7Q16629 SH3BP2-218ENST00000511185 1071 ntTSL 214.64□□□□□ -0.077e-7■■■□□ 17
SRSF7Q16629 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.157e-11■■■□□ 17
SRSF7Q16629 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 511.83□□□□□ -0.527e-7■■■□□ 17
SRSF7Q16629 SH3BP2-213ENST00000508385 876 ntTSL 311.76□□□□□ -0.537e-7■■■□□ 17
SRSF7Q16629 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.717e-7■■■□□ 17
SRSF7Q16629 SH3BP2-222ENST00000512014 688 ntTSL 39.91□□□□□ -0.827e-7■■■□□ 17
SRSF7Q16629 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-8■■■□□ 17
SRSF7Q16629 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-8■■■□□ 17
SRSF7Q16629 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 315.47■□□□□ 0.072e-8■■■□□ 17
SRSF7Q16629 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-8■■■□□ 17
SRSF7Q16629 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 59.87□□□□□ -0.832e-8■■■□□ 17
SRSF7Q16629 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.132e-14■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 HSP90B1-206ENST00000550479 698 ntTSL 24.86□□□□□ -1.632e-14■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-222ENST00000596378 2314 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.682e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-207ENST00000468822 768 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-217ENST00000490543 673 ntTSL 56.94□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-205ENST00000462710 2624 ntTSL 56.86□□□□□ -1.312e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-212ENST00000479034 2671 ntTSL 55.71□□□□□ -1.492e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-219ENST00000495561 563 ntTSL 25.63□□□□□ -1.512e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-218ENST00000494934 802 ntTSL 35.27□□□□□ -1.572e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.682e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.742e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SRRM1-211ENST00000478890 480 ntTSL 31.91□□□□□ -2.12e-6■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 314.64□□□□□ -0.072e-9■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-9■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.272e-9■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SMAD3-213ENST00000560175 542 ntTSL 410.46□□□□□ -0.732e-9■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 47.65□□□□□ -1.182e-9■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SMAD3-212ENST00000559937 579 ntTSL 47.01□□□□□ -1.292e-9■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 MSI2-216ENST00000582772 398 ntTSL 33.85□□□□□ -1.792e-9■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SH3PXD2A-204ENST00000420222 3251 ntTSL 212.49□□□□□ -0.418e-10■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 SH3PXD2A-201ENST00000315994 5504 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.698e-10■■■□□ 16.9
SRSF7Q16629 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.665e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.435e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 PTPRF-202ENST00000372405 1962 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.555e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)9.95□□□□□ -0.825e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.172e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-208ENST00000481220 751 ntTSL 314.21□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-203ENST00000464115 712 ntTSL 314.21□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.612e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-202ENST00000461832 675 ntTSL 211.16□□□□□ -0.622e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)10.07□□□□□ -0.82e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.12e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.52e-7■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.723e-6■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-6■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 CREBZF-206ENST00000528561 1099 ntTSL 516.15■□□□□ 0.187e-9■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 CREBZF-203ENST00000525639 2850 ntTSL 515.34■□□□□ 0.057e-9■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 CREBZF-201ENST00000260058 1431 ntTSL 213.74□□□□□ -0.217e-9■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 CREBZF-205ENST00000527529 898 ntTSL 512.12□□□□□ -0.477e-9■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 CREBZF-202ENST00000490820 4329 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.557e-9■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.597e-9■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 CREBZF-208ENST00000531515 724 ntTSL 310.94□□□□□ -0.667e-9■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.597e-9■■■□□ 16.8
SRSF7Q16629 RBM39-204ENST00000374038 1026 ntTSL 512.72□□□□□ -0.375e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 RBM39-215ENST00000442447 644 ntTSL 212.67□□□□□ -0.385e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 211.82□□□□□ -0.525e-7■■■□□ 16.7
SRSF7Q16629 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 211.66□□□□□ -0.545e-7■■■□□ 16.7
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