Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.812e-7■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 WAC-206ENST00000414108 816 ntTSL 33.74□□□□□ -1.817e-21■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 FAF1-204ENST00000487898 681 ntTSL 33.38□□□□□ -1.871e-8■■■■□ 25.7
ILF3Q12906 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.22□□□□□ -1.731e-323■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.21e-9■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.381e-9■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.631e-9■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ASXL1-205ENST00000497249 296 ntTSL 52.68□□□□□ -1.981e-9■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 RER1-206ENST00000462129 585 ntTSL 217.7■□□□□ 0.424e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.392e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.272e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.082e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-210ENST00000606248 3181 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 NBEAL1-210ENST00000497505 2372 ntTSL 512.63□□□□□ -0.394e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 NBEAL1-207ENST00000478884 1012 ntTSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.014e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 NBEAL1-205ENST00000460416 518 ntTSL 57.83□□□□□ -1.161e-9■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 NBEAL1-209ENST00000492870 439 ntTSL 33.79□□□□□ -1.81e-9■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.864e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.251e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)22.85■■□□□ 1.251e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.231e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.161e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.461e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-217ENST00000624668 583 ntTSL 515.48■□□□□ 0.072e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-215ENST00000624193 463 ntTSL 415.33■□□□□ 0.042e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-211ENST00000623321 1860 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.092e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-208ENST00000622960 628 ntTSL 513.07□□□□□ -0.322e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.642e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-213ENST00000624032 3071 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.652e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.562e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.572e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)3.53□□□□□ -1.842e-8■■■■□ 25.6
ILF3Q12906 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.143e-12■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-12■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.223e-12■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.383e-12■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-9■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-9■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-204ENST00000467997 1373 ntTSL 522.13■■□□□ 1.131e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-220ENST00000508952 987 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.111e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-217ENST00000506951 936 ntTSL 1 (best)21.9■■□□□ 1.11e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.071e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 UBA1-206ENST00000442035 1054 ntTSL 521.07■□□□□ 0.961e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.941e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.941e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.881e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.671e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.471e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 ORC5-207ENST00000485726 1214 ntTSL 317.23■□□□□ 0.351e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 UBA1-208ENST00000457753 809 ntTSL 517.06■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-215ENST00000506702 1233 ntTSL 516.39■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 ORC5-202ENST00000422497 2043 ntTSL 215.35■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 UBA1-204ENST00000412206 1148 ntTSL 514.32□□□□□ -0.121e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 IGF2BP1-206ENST00000515586 768 ntTSL 314.26□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 STAM-201ENST00000377500 729 ntTSL 514.12□□□□□ -0.153e-8■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-8■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 UBA1-205ENST00000427561 671 ntTSL 513.69□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 STAM-203ENST00000445846 740 ntTSL 411.94□□□□□ -0.53e-8■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 UBA1-207ENST00000451702 1706 ntTSL 510.67□□□□□ -0.71e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 Z82206.1-201ENST00000424496 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.741e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 GRAP2-206ENST00000478445 583 ntTSL 46.33□□□□□ -1.41e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 ORC5-205ENST00000463152 528 ntTSL 36.29□□□□□ -1.41e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.451e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.551e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-205ENST00000471979 1394 ntTSL 25.02□□□□□ -1.611e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-213ENST00000506552 414 ntTSL 33.75□□□□□ -1.811e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 STAM-204ENST00000486183 274 ntTSL 33.31□□□□□ -1.883e-8■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PACRGL-214ENST00000506648 577 ntTSL 23□□□□□ -1.931e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.54e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 SHARPIN-201ENST00000359551 1687 ntTSL 1 (best)24.21■■□□□ 1.474e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 SHARPIN-209ENST00000534242 933 ntTSL 222.84■■□□□ 1.254e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 SHARPIN-208ENST00000533948 981 ntTSL 514.33□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 214.26□□□□□ -0.135e-12■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 212.09□□□□□ -0.475e-12■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 217.19■□□□□ 0.344e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 214.01□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)12.89□□□□□ -0.354e-7■■■■□ 25.5
ILF3Q12906 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.267e-7■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 DOCK4-212ENST00000476846 3218 ntTSL 513.41□□□□□ -0.267e-7■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.557e-7■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 HIPK3-205ENST00000531504 591 ntTSL 219.88■□□□□ 0.773e-13■■■■□ 25.4
ILF3Q12906 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-13■■■■□ 25.4
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