Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC4O75487 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC4O75487 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC4O75487 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC4O75487 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC4O75487 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC4O75487 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC4O75487 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC4O75487 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GPC4O75487 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC4O75487 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC4O75487 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC4O75487 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC4O75487 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPC4O75487 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC4O75487 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC4O75487 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC4O75487 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC4O75487 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC4O75487 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC4O75487 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC4O75487 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPC4O75487 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC4O75487 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC4O75487 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC4O75487 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC4O75487 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC4O75487 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC4O75487 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPC4O75487 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPC4O75487 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPC4O75487 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GPC4O75487 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPC4O75487 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPC4O75487 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC4O75487 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC4O75487 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC4O75487 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC4O75487 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC4O75487 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPC4O75487 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC4O75487 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC4O75487 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC4O75487 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC4O75487 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC4O75487 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC4O75487 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPC4O75487 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPC4O75487 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPC4O75487 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms