Protein–RNA interactions for Protein: O00212

RHOD, Rho-related GTP-binding protein RhoD, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHODO00212 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHODO00212 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHODO00212 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RHODO00212 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RHODO00212 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RHODO00212 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RHODO00212 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RHODO00212 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RHODO00212 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RHODO00212 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RHODO00212 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms