Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.181e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-12■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.412e-12■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 MYO18A-213ENST00000532143 1002 ntTSL 315.37■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 ARPC2-208ENST00000465395 816 ntTSL 27.26□□□□□ -1.252e-8■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 MAGED1-205ENST00000470461 810 ntTSL 26.1□□□□□ -1.435e-8■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.325e-12■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.475e-12■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.462e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 PIPOX-208ENST00000580241 1772 ntTSL 519.27■□□□□ 0.688e-9■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 PIPOX-210ENST00000583215 1829 ntTSL 518.23■□□□□ 0.518e-9■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.138e-9■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 515.65■□□□□ 0.14e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 513.76□□□□□ -0.214e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 513.74□□□□□ -0.214e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-206ENST00000460389 1075 ntTSL 513.34□□□□□ -0.274e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-222ENST00000494153 757 ntTSL 512.95□□□□□ -0.344e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-207ENST00000464173 587 ntTSL 212.25□□□□□ -0.454e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-217ENST00000483310 755 ntTSL 311.2□□□□□ -0.624e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-209ENST00000464661 906 ntTSL 310.96□□□□□ -0.654e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 510.54□□□□□ -0.724e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 HM13-214ENST00000472128 865 ntTSL 59.49□□□□□ -0.894e-13■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NDE1-205ENST00000572756 915 ntTSL 515.18■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NDE1-203ENST00000570727 588 ntTSL 413.58□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NDE1-207ENST00000573203 762 ntTSL 38.49□□□□□ -1.051e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.381e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.341e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.431e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 PNKP-223ENST00000629179 811 ntTSL 413.36□□□□□ -0.271e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.082e-16■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 ARHGDIA-215ENST00000583868 815 ntTSL 312.56□□□□□ -0.42e-16■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 SYNE4-205ENST00000490730 1175 ntTSL 219.35■□□□□ 0.696e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 MNT-204ENST00000572892 556 ntTSL 419.18■□□□□ 0.666e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 MNT-202ENST00000571232 508 ntTSL 418.56■□□□□ 0.566e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 ZNF580-205ENST00000592461 377 ntTSL 318.26■□□□□ 0.516e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.56e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 SYNE4-204ENST00000465425 2339 ntTSL 218.07■□□□□ 0.486e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 TXN2-205ENST00000487725 736 ntTSL 317.76■□□□□ 0.436e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.416e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 SYNE4-207ENST00000505054 713 ntTSL 316.04■□□□□ 0.166e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 MNT-207ENST00000575374 936 ntTSL 314.06□□□□□ -0.166e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.456e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 TXN2-202ENST00000403313 912 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.576e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 SYNE4-206ENST00000503121 453 ntTSL 311.29□□□□□ -0.66e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 SYNE4-203ENST00000397428 382 ntTSL 310.89□□□□□ -0.676e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NPIPB3-210ENST00000542817 1342 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.763e-22■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 NPIPB3-203ENST00000504841 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.383e-22■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 CFDP1-204ENST00000564793 457 ntTSL 35.84□□□□□ -1.476e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 MAN2A1-203ENST00000503970 5599 ntTSL 23.45□□□□□ -1.869e-33■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.675e-8■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-20■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51e-323■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 317.44■□□□□ 0.381e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.211e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 ESPN-209ENST00000477679 885 ntTSL 213□□□□□ -0.338e-25■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 314.95□□□□□ -0.022e-8■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 TNRC18-206ENST00000434361 577 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 IGDCC3-202ENST00000558354 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.14■□□□□ 0.56e-7■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 213.3□□□□□ -0.283e-14■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 POLR2E-203ENST00000586215 756 ntTSL 213.9□□□□□ -0.181e-12■■■□□ 14.7
PCBP2Q15366 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-9■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.822e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 321.81■■□□□ 1.082e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 521.22■□□□□ 0.992e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 312.47□□□□□ -0.412e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.159e-14■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 EPB41L5-204ENST00000443902 3167 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 DQX1-205ENST00000473508 2136 ntTSL 214.82□□□□□ -0.042e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.913e-11■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 FBXO17-203ENST00000596025 935 ntTSL 218.54■□□□□ 0.563e-11■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.311e-323■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.958e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 513.28□□□□□ -0.282e-7■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.43e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 FOXA3-202ENST00000594297 538 ntTSL 314.66□□□□□ -0.063e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.832e-8■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.393e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RNF2-204ENST00000498201 631 ntTSL 215.52■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RNF2-202ENST00000367510 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 RNF2-203ENST00000453650 939 ntTSL 58.74□□□□□ -1.013e-6■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GDI2-209ENST00000609712 622 ntTSL 311.68□□□□□ -0.543e-40■■■□□ 14.6
PCBP2Q15366 GDI2-204ENST00000418688 636 ntTSL 510.49□□□□□ -0.733e-40■■■□□ 14.6
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 289.6 ms