Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
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SNAPC1Q16533 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNAPC1Q16533 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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