Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CKMT2P17540 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms