RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439057.5

KDM4A-AS1-204, KDM4A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDM4A-AS1, Length 686 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.28■■■■□ 3.72
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.91■■■□□ 2.7
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.69■■■□□ 2.66
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.51■■■□□ 2.47
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.27■■■□□ 2.44
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 SMARCA2P51531 1590 aa29.61■■■□□ 2.33
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.55■■■□□ 2.32
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.52■■■□□ 2.32
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.83■■■□□ 2.21
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CFTRP13569 1480 aa28.57■■■□□ 2.16
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PRDM2Q13029 1718 aa28.51■■■□□ 2.15
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 WDR62O43379 1518 aa28.48■■■□□ 2.15
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.47■■■□□ 2.15
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.46■■■□□ 2.15
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.46■■■□□ 2.15
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PBRM1Q86U86 1689 aa27.37■■□□□ 1.97
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.37■■□□□ 1.97
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 GRIN2BQ13224 1484 aa27.29■■□□□ 1.96
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.26■■□□□ 1.95
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.26■■□□□ 1.95
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.15■■□□□ 1.94
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ADAMTS12P58397 1594 aa27.13■■□□□ 1.93
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 FBLN2P98095 1184 aa27.12■■□□□ 1.93
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 TRIM41Q8WV44 630 aa27.09■■□□□ 1.93
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.02■■□□□ 1.92
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 GRIN2AQ12879 1464 aa26.99■■□□□ 1.91
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ARAP1Q96P48 1450 aa26.96■■□□□ 1.91
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CEP170Q5SW79 1584 aa26.92■■□□□ 1.9
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.92■■□□□ 1.9
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 NUP160Q12769 1436 aa26.89■■□□□ 1.89
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 SHROOM2Q13796 1616 aa26.79■■□□□ 1.88
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 KIF27Q86VH2 1401 aa26.77■■□□□ 1.88
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CUL7Q14999 1698 aa26.76■■□□□ 1.87
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.76■■□□□ 1.87
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.74■■□□□ 1.87
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KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.51■■□□□ 1.83
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