RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.05■■■□□ 2.88
POP4-201ENST00000221770 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.23■■■□□ 2.11
POP4-201ENST00000221770 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
POP4-201ENST00000221770 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.84■■■□□ 2.05
POP4-201ENST00000221770 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.34■■□□□ 1.97
POP4-201ENST00000221770 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
POP4-201ENST00000221770 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.22■■□□□ 1.95
POP4-201ENST00000221770 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.54■■□□□ 1.84
POP4-201ENST00000221770 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.49■■□□□ 1.83
POP4-201ENST00000221770 SCRIBQ14160 1630 aa26.28■■□□□ 1.8
POP4-201ENST00000221770 ABCC9O60706 1549 aa26.25■■□□□ 1.79
POP4-201ENST00000221770 NACADO15069 1562 aa26.18■■□□□ 1.78
POP4-201ENST00000221770 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
POP4-201ENST00000221770 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.76■■□□□ 1.71
POP4-201ENST00000221770 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.71■■□□□ 1.71
POP4-201ENST00000221770 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.62■■□□□ 1.69
POP4-201ENST00000221770 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.62■■□□□ 1.69
POP4-201ENST00000221770 TRIM41Q8WV44 630 aa25.51■■□□□ 1.67
POP4-201ENST00000221770 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
POP4-201ENST00000221770 WIZO95785 1651 aa25.44■■□□□ 1.66
POP4-201ENST00000221770 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
POP4-201ENST00000221770 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.39■■□□□ 1.66
POP4-201ENST00000221770 HRCP23327 699 aa25.32■■□□□ 1.64
POP4-201ENST00000221770 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.23■■□□□ 1.63
POP4-201ENST00000221770 SMARCA4P51532 1647 aa25.18■■□□□ 1.62
POP4-201ENST00000221770 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
POP4-201ENST00000221770 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
POP4-201ENST00000221770 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
POP4-201ENST00000221770 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
POP4-201ENST00000221770 CCDC88BA6NC98 1476 aa25■■□□□ 1.59
POP4-201ENST00000221770 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
POP4-201ENST00000221770 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.99■■□□□ 1.59
POP4-201ENST00000221770 SMARCA2P51531 1590 aa24.95■■□□□ 1.58
POP4-201ENST00000221770 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.85■■□□□ 1.57
POP4-201ENST00000221770 MYT1Q01538 1121 aa24.8■■□□□ 1.56
POP4-201ENST00000221770 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.78■■□□□ 1.56
POP4-201ENST00000221770 ABCC8Q09428 1581 aa24.77■■□□□ 1.56
POP4-201ENST00000221770 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
POP4-201ENST00000221770 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.61■■□□□ 1.53
POP4-201ENST00000221770 EEA1Q15075 1411 aa24.55■■□□□ 1.52
POP4-201ENST00000221770 SOGA1O94964 1423 aa24.54■■□□□ 1.52
POP4-201ENST00000221770 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
POP4-201ENST00000221770 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
POP4-201ENST00000221770 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
POP4-201ENST00000221770 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.49■■□□□ 1.51
POP4-201ENST00000221770 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.42■■□□□ 1.5
POP4-201ENST00000221770 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.4■■□□□ 1.5
POP4-201ENST00000221770 CEP162Q5TB80 1403 aa24.36■■□□□ 1.49
POP4-201ENST00000221770 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
POP4-201ENST00000221770 SYNJ1O43426 1573 aa24.31■■□□□ 1.48
POP4-201ENST00000221770 GOLGA3Q08378 1498 aa24.29■■□□□ 1.48
POP4-201ENST00000221770 NCAPD3P42695 1498 aa24.22■■□□□ 1.47
POP4-201ENST00000221770 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.19■■□□□ 1.46
POP4-201ENST00000221770 HMGXB3Q12766 1538 aa24.18■■□□□ 1.46
POP4-201ENST00000221770 KIF21BO75037 1637 aa24.14■■□□□ 1.45
POP4-201ENST00000221770 TOP2BQ02880 1626 aa24.1■■□□□ 1.45
POP4-201ENST00000221770 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
POP4-201ENST00000221770 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.01■■□□□ 1.43
POP4-201ENST00000221770 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
POP4-201ENST00000221770 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
POP4-201ENST00000221770 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
POP4-201ENST00000221770 CLIP1P30622 1438 aa23.98■■□□□ 1.43
POP4-201ENST00000221770 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.96■■□□□ 1.43
POP4-201ENST00000221770 CFTRP13569 1480 aa23.94■■□□□ 1.42
POP4-201ENST00000221770 CUX1P39880 1505 aa23.87■■□□□ 1.41
POP4-201ENST00000221770 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.87■■□□□ 1.41
POP4-201ENST00000221770 PRXQ9BXM0 1461 aa23.82■■□□□ 1.4
POP4-201ENST00000221770 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.82■■□□□ 1.4
POP4-201ENST00000221770 APLP2Q06481 763 aa23.79■■□□□ 1.4
POP4-201ENST00000221770 KIF27Q86VH2 1401 aa23.79■■□□□ 1.4
POP4-201ENST00000221770 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
POP4-201ENST00000221770 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.73■■□□□ 1.39
POP4-201ENST00000221770 PRDM2Q13029 1718 aa23.68■■□□□ 1.38
POP4-201ENST00000221770 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.62■■□□□ 1.37
POP4-201ENST00000221770 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
POP4-201ENST00000221770 ARAP1Q96P48 1450 aa23.59■■□□□ 1.37
POP4-201ENST00000221770 CUX2O14529 1486 aa23.55■■□□□ 1.36
POP4-201ENST00000221770 IGF1RP08069 1367 aa23.53■■□□□ 1.36
POP4-201ENST00000221770 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.49■■□□□ 1.35
POP4-201ENST00000221770 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.45■■□□□ 1.34
POP4-201ENST00000221770 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.44■■□□□ 1.34
POP4-201ENST00000221770 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.43■■□□□ 1.34
POP4-201ENST00000221770 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
POP4-201ENST00000221770 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
POP4-201ENST00000221770 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
POP4-201ENST00000221770 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.32■■□□□ 1.32
POP4-201ENST00000221770 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
POP4-201ENST00000221770 TOPBP1Q92547 1522 aa23.27■■□□□ 1.32
POP4-201ENST00000221770 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.26■■□□□ 1.31
POP4-201ENST00000221770 NESP48681 1621 aa23.26■■□□□ 1.31
POP4-201ENST00000221770 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.25■■□□□ 1.31
POP4-201ENST00000221770 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
POP4-201ENST00000221770 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.23■■□□□ 1.31
POP4-201ENST00000221770 MAP3K1Q13233 1512 aa23.22■■□□□ 1.31
POP4-201ENST00000221770 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.2■■□□□ 1.3
POP4-201ENST00000221770 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.19■■□□□ 1.3
POP4-201ENST00000221770 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
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POP4-201ENST00000221770 TIAM1Q13009 1591 aa23.15■■□□□ 1.3
POP4-201ENST00000221770 CUL7Q14999 1698 aa23.1■■□□□ 1.29
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