Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CKMT2P17540 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CKMT2P17540 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CKMT2P17540 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CKMT2P17540 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CKMT2P17540 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CKMT2P17540 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CKMT2P17540 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CKMT2P17540 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CKMT2P17540 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CKMT2P17540 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CKMT2P17540 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CKMT2P17540 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CKMT2P17540 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CKMT2P17540 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CKMT2P17540 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CKMT2P17540 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CKMT2P17540 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CKMT2P17540 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CKMT2P17540 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CKMT2P17540 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CKMT2P17540 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CKMT2P17540 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CKMT2P17540 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CKMT2P17540 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CKMT2P17540 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CKMT2P17540 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CKMT2P17540 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CKMT2P17540 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CKMT2P17540 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CKMT2P17540 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CKMT2P17540 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CKMT2P17540 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CKMT2P17540 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CKMT2P17540 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CKMT2P17540 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CKMT2P17540 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CKMT2P17540 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CKMT2P17540 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CKMT2P17540 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CKMT2P17540 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CKMT2P17540 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CKMT2P17540 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CKMT2P17540 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CKMT2P17540 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CKMT2P17540 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CKMT2P17540 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CKMT2P17540 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CKMT2P17540 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CKMT2P17540 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CKMT2P17540 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CKMT2P17540 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CKMT2P17540 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CKMT2P17540 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CKMT2P17540 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CKMT2P17540 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CKMT2P17540 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CKMT2P17540 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CKMT2P17540 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CKMT2P17540 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CKMT2P17540 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CKMT2P17540 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CKMT2P17540 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CKMT2P17540 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CKMT2P17540 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CKMT2P17540 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CKMT2P17540 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKMT2P17540 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKMT2P17540 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CKMT2P17540 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CKMT2P17540 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CKMT2P17540 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CKMT2P17540 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CKMT2P17540 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CKMT2P17540 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CKMT2P17540 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CKMT2P17540 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CKMT2P17540 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CKMT2P17540 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CKMT2P17540 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CKMT2P17540 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CKMT2P17540 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CKMT2P17540 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CKMT2P17540 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CKMT2P17540 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CKMT2P17540 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CKMT2P17540 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CKMT2P17540 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CKMT2P17540 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CKMT2P17540 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CKMT2P17540 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CKMT2P17540 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CKMT2P17540 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CKMT2P17540 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKMT2P17540 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CKMT2P17540 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CKMT2P17540 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CKMT2P17540 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CKMT2P17540 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CKMT2P17540 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms