Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3GL3Q99963 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SH3GL3Q99963 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms