Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SH3GL3Q99963 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SH3GL3Q99963 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SH3GL3Q99963 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SH3GL3Q99963 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SH3GL3Q99963 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SH3GL3Q99963 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SH3GL3Q99963 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SH3GL3Q99963 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SH3GL3Q99963 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SH3GL3Q99963 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SH3GL3Q99963 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SH3GL3Q99963 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SH3GL3Q99963 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SH3GL3Q99963 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SH3GL3Q99963 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3GL3Q99963 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SH3GL3Q99963 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH3GL3Q99963 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH3GL3Q99963 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SH3GL3Q99963 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3GL3Q99963 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GL3Q99963 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SH3GL3Q99963 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3GL3Q99963 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SH3GL3Q99963 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3GL3Q99963 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SH3GL3Q99963 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3GL3Q99963 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SH3GL3Q99963 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3GL3Q99963 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3GL3Q99963 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SH3GL3Q99963 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SH3GL3Q99963 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH3GL3Q99963 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SH3GL3Q99963 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SH3GL3Q99963 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH3GL3Q99963 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH3GL3Q99963 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH3GL3Q99963 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH3GL3Q99963 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH3GL3Q99963 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH3GL3Q99963 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH3GL3Q99963 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SH3GL3Q99963 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SH3GL3Q99963 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
SH3GL3Q99963 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SH3GL3Q99963 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SH3GL3Q99963 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SH3GL3Q99963 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3GL3Q99963 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SH3GL3Q99963 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3GL3Q99963 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SH3GL3Q99963 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SH3GL3Q99963 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SH3GL3Q99963 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH3GL3Q99963 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SH3GL3Q99963 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SH3GL3Q99963 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SH3GL3Q99963 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SH3GL3Q99963 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3GL3Q99963 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH3GL3Q99963 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH3GL3Q99963 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH3GL3Q99963 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3GL3Q99963 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH3GL3Q99963 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH3GL3Q99963 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH3GL3Q99963 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3GL3Q99963 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3GL3Q99963 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3GL3Q99963 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3GL3Q99963 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3GL3Q99963 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3GL3Q99963 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3GL3Q99963 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3GL3Q99963 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3GL3Q99963 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3GL3Q99963 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3GL3Q99963 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3GL3Q99963 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3GL3Q99963 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SH3GL3Q99963 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3GL3Q99963 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3GL3Q99963 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3GL3Q99963 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3GL3Q99963 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3GL3Q99963 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3GL3Q99963 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3GL3Q99963 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3GL3Q99963 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3GL3Q99963 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3GL3Q99963 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GL3Q99963 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SH3GL3Q99963 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3GL3Q99963 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GL3Q99963 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3GL3Q99963 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SH3GL3Q99963 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SH3GL3Q99963 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms