RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262288.7

SCPEP1-201, Transcript of serine carboxypeptidase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCPEP1, Length 1,942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1-201ENST00000262288 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.35■■■■□ 3.25
SCPEP1-201ENST00000262288 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.55■■■□□ 2.48
SCPEP1-201ENST00000262288 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SCPEP1-201ENST00000262288 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.34■■■□□ 2.29
SCPEP1-201ENST00000262288 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.31■■■□□ 2.28
SCPEP1-201ENST00000262288 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.11■■■□□ 2.25
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCC9O60706 1549 aa28.82■■■□□ 2.2
SCPEP1-201ENST00000262288 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.6■■■□□ 2.17
SCPEP1-201ENST00000262288 NACADO15069 1562 aa28.41■■■□□ 2.14
SCPEP1-201ENST00000262288 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
SCPEP1-201ENST00000262288 SCRIBQ14160 1630 aa28.33■■■□□ 2.13
SCPEP1-201ENST00000262288 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.11■■■□□ 2.09
SCPEP1-201ENST00000262288 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.64■■■□□ 2.02
SCPEP1-201ENST00000262288 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
SCPEP1-201ENST00000262288 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.56■■■□□ 2
SCPEP1-201ENST00000262288 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.4■■□□□ 1.98
SCPEP1-201ENST00000262288 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
SCPEP1-201ENST00000262288 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.34■■□□□ 1.97
SCPEP1-201ENST00000262288 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.26■■□□□ 1.95
SCPEP1-201ENST00000262288 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
SCPEP1-201ENST00000262288 WIZO95785 1651 aa27.21■■□□□ 1.95
SCPEP1-201ENST00000262288 SMARCA4P51532 1647 aa27.1■■□□□ 1.93
SCPEP1-201ENST00000262288 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SCPEP1-201ENST00000262288 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.67■■□□□ 1.86
SCPEP1-201ENST00000262288 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.65■■□□□ 1.86
SCPEP1-201ENST00000262288 SMARCA2P51531 1590 aa26.63■■□□□ 1.85
SCPEP1-201ENST00000262288 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.59■■□□□ 1.85
SCPEP1-201ENST00000262288 TRIM41Q8WV44 630 aa26.55■■□□□ 1.84
SCPEP1-201ENST00000262288 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SCPEP1-201ENST00000262288 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SCPEP1-201ENST00000262288 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.35■■□□□ 1.81
SCPEP1-201ENST00000262288 NCAPD3P42695 1498 aa26.26■■□□□ 1.79
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCC8Q09428 1581 aa26.25■■□□□ 1.79
SCPEP1-201ENST00000262288 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SCPEP1-201ENST00000262288 HMGXB3Q12766 1538 aa26.2■■□□□ 1.78
SCPEP1-201ENST00000262288 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.02■■□□□ 1.76
SCPEP1-201ENST00000262288 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
SCPEP1-201ENST00000262288 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.93■■□□□ 1.74
SCPEP1-201ENST00000262288 SYNJ1O43426 1573 aa25.86■■□□□ 1.73
SCPEP1-201ENST00000262288 SOGA1O94964 1423 aa25.83■■□□□ 1.73
SCPEP1-201ENST00000262288 CFTRP13569 1480 aa25.79■■□□□ 1.72
SCPEP1-201ENST00000262288 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.76■■□□□ 1.71
SCPEP1-201ENST00000262288 EEA1Q15075 1411 aa25.69■■□□□ 1.7
SCPEP1-201ENST00000262288 TOP2BQ02880 1626 aa25.66■■□□□ 1.7
SCPEP1-201ENST00000262288 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.66■■□□□ 1.7
SCPEP1-201ENST00000262288 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.65■■□□□ 1.7
SCPEP1-201ENST00000262288 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.62■■□□□ 1.69
SCPEP1-201ENST00000262288 PRDM2Q13029 1718 aa25.6■■□□□ 1.69
SCPEP1-201ENST00000262288 CUX1P39880 1505 aa25.58■■□□□ 1.69
SCPEP1-201ENST00000262288 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.51■■□□□ 1.67
SCPEP1-201ENST00000262288 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.48■■□□□ 1.67
SCPEP1-201ENST00000262288 NESP48681 1621 aa25.43■■□□□ 1.66
SCPEP1-201ENST00000262288 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.4■■□□□ 1.66
SCPEP1-201ENST00000262288 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
SCPEP1-201ENST00000262288 GOLGA3Q08378 1498 aa25.4■■□□□ 1.66
SCPEP1-201ENST00000262288 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.39■■□□□ 1.65
SCPEP1-201ENST00000262288 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SCPEP1-201ENST00000262288 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.35■■□□□ 1.65
SCPEP1-201ENST00000262288 KIF21BO75037 1637 aa25.35■■□□□ 1.65
SCPEP1-201ENST00000262288 CEP162Q5TB80 1403 aa25.32■■□□□ 1.64
SCPEP1-201ENST00000262288 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.29■■□□□ 1.64
SCPEP1-201ENST00000262288 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.25■■□□□ 1.63
SCPEP1-201ENST00000262288 KIF27Q86VH2 1401 aa25.24■■□□□ 1.63
SCPEP1-201ENST00000262288 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.24■■□□□ 1.63
SCPEP1-201ENST00000262288 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.17■■□□□ 1.62
SCPEP1-201ENST00000262288 PRXQ9BXM0 1461 aa25.16■■□□□ 1.62
SCPEP1-201ENST00000262288 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SCPEP1-201ENST00000262288 CUX2O14529 1486 aa25.15■■□□□ 1.62
SCPEP1-201ENST00000262288 TOPBP1Q92547 1522 aa25.15■■□□□ 1.62
SCPEP1-201ENST00000262288 HRCP23327 699 aa25.12■■□□□ 1.61
SCPEP1-201ENST00000262288 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.12■■□□□ 1.61
SCPEP1-201ENST00000262288 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.1■■□□□ 1.61
SCPEP1-201ENST00000262288 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SCPEP1-201ENST00000262288 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.07■■□□□ 1.6
SCPEP1-201ENST00000262288 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SCPEP1-201ENST00000262288 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.05■■□□□ 1.6
SCPEP1-201ENST00000262288 IGF1RP08069 1367 aa25.05■■□□□ 1.6
SCPEP1-201ENST00000262288 CLIP1P30622 1438 aa25.04■■□□□ 1.6
SCPEP1-201ENST00000262288 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.96■■□□□ 1.59
SCPEP1-201ENST00000262288 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.92■■□□□ 1.58
SCPEP1-201ENST00000262288 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SCPEP1-201ENST00000262288 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.84■■□□□ 1.57
SCPEP1-201ENST00000262288 WDR97A6NE52 1622 aa24.84■■□□□ 1.57
SCPEP1-201ENST00000262288 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SCPEP1-201ENST00000262288 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.78■■□□□ 1.56
SCPEP1-201ENST00000262288 ARAP1Q96P48 1450 aa24.77■■□□□ 1.56
SCPEP1-201ENST00000262288 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SCPEP1-201ENST00000262288 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.73■■□□□ 1.55
SCPEP1-201ENST00000262288 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.7■■□□□ 1.55
SCPEP1-201ENST00000262288 CUL7Q14999 1698 aa24.7■■□□□ 1.54
SCPEP1-201ENST00000262288 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.7■■□□□ 1.54
SCPEP1-201ENST00000262288 APLP2Q06481 763 aa24.65■■□□□ 1.54
SCPEP1-201ENST00000262288 WDR62O43379 1518 aa24.62■■□□□ 1.53
SCPEP1-201ENST00000262288 ERCC6Q03468 1493 aa24.61■■□□□ 1.53
SCPEP1-201ENST00000262288 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SCPEP1-201ENST00000262288 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
SCPEP1-201ENST00000262288 PBRM1Q86U86 1689 aa24.52■■□□□ 1.52
SCPEP1-201ENST00000262288 IFT140Q96RY7 1462 aa24.52■■□□□ 1.52
SCPEP1-201ENST00000262288 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.51■■□□□ 1.51
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