Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GDPD1Q8N9F7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GDPD1Q8N9F7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms