RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.22■■■■■ 4.51
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NACADO15069 1562 aa36.21■■■■□ 3.39
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.01■■■■□ 3.36
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SCRIBQ14160 1630 aa35.06■■■■□ 3.2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.84■■■■□ 3.17
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.12■■■■□ 3.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.11■■■■□ 3.05
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SMARCA4P51532 1647 aa33.57■■■□□ 2.97
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.57■■■□□ 2.96
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCAPD3P42695 1498 aa33.4■■■□□ 2.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.38■■■□□ 2.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SMARCA2P51531 1590 aa33.36■■■□□ 2.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.29■■■□□ 2.92
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.29■■■□□ 2.92
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HMGXB3Q12766 1538 aa33.25■■■□□ 2.91
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WIZO95785 1651 aa32.94■■■□□ 2.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CUX2O14529 1486 aa32.8■■■□□ 2.84
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ERCC6Q03468 1493 aa32.68■■■□□ 2.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NESP48681 1621 aa32.58■■■□□ 2.81
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.55■■■□□ 2.8
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.39■■■□□ 2.78
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.28■■■□□ 2.76
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.25■■■□□ 2.75
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CFTRP13569 1480 aa32.21■■■□□ 2.75
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.18■■■□□ 2.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRDM2Q13029 1718 aa32.04■■■□□ 2.72
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.01■■■□□ 2.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.99■■■□□ 2.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.97■■■□□ 2.71
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WDR62O43379 1518 aa31.9■■■□□ 2.7
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCC8Q09428 1581 aa31.52■■■□□ 2.64
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TOPBP1Q92547 1522 aa31.51■■■□□ 2.63
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.49■■■□□ 2.63
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IFT140Q96RY7 1462 aa31.33■■■□□ 2.61
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OSCARQ8IYS5 282 aa31.33■■■□□ 2.61
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CUX1P39880 1505 aa31.24■■■□□ 2.59
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.14■■■□□ 2.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SOGA1O94964 1423 aa31.07■■■□□ 2.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.07■■■□□ 2.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WDR97A6NE52 1622 aa31■■■□□ 2.55
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31■■■□□ 2.55
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.98■■■□□ 2.55
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TOP2BQ02880 1626 aa30.98■■■□□ 2.55
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.55
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SYNJ1O43426 1573 aa30.95■■■□□ 2.54
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.86■■■□□ 2.53
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.82■■■□□ 2.52
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.82■■■□□ 2.52
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.82■■■□□ 2.52
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.77■■■□□ 2.52
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GRIN2BQ13224 1484 aa30.75■■■□□ 2.51
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHD1O14646 1710 aa30.73■■■□□ 2.51
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.73■■■□□ 2.51
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PBRM1Q86U86 1689 aa30.73■■■□□ 2.51
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.7■■■□□ 2.51
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGEF11O15085 1522 aa30.69■■■□□ 2.5
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.64■■■□□ 2.5
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SYNJ2O15056 1496 aa30.57■■■□□ 2.48
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBLN2P98095 1184 aa30.54■■■□□ 2.48
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.38■■■□□ 2.45
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FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIF27Q86VH2 1401 aa30.35■■■□□ 2.45
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARAP1Q96P48 1450 aa30.34■■■□□ 2.45
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NUP160Q12769 1436 aa30.24■■■□□ 2.43
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IGF1RP08069 1367 aa30.23■■■□□ 2.43
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CEP170Q5SW79 1584 aa30.22■■■□□ 2.43
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CUL7Q14999 1698 aa30.22■■■□□ 2.43
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SHROOM2Q13796 1616 aa30.07■■■□□ 2.4
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.04■■■□□ 2.4
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