Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GDPD1Q8N9F7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GDPD1Q8N9F7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GDPD1Q8N9F7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GDPD1Q8N9F7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GDPD1Q8N9F7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GDPD1Q8N9F7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GDPD1Q8N9F7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GDPD1Q8N9F7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GDPD1Q8N9F7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GDPD1Q8N9F7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GDPD1Q8N9F7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDPD1Q8N9F7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDPD1Q8N9F7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDPD1Q8N9F7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDPD1Q8N9F7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD1Q8N9F7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD1Q8N9F7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GDPD1Q8N9F7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDPD1Q8N9F7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDPD1Q8N9F7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GDPD1Q8N9F7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDPD1Q8N9F7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GDPD1Q8N9F7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GDPD1Q8N9F7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GDPD1Q8N9F7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GDPD1Q8N9F7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GDPD1Q8N9F7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GDPD1Q8N9F7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GDPD1Q8N9F7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDPD1Q8N9F7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GDPD1Q8N9F7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GDPD1Q8N9F7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GDPD1Q8N9F7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GDPD1Q8N9F7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GDPD1Q8N9F7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDPD1Q8N9F7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GDPD1Q8N9F7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GDPD1Q8N9F7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GDPD1Q8N9F7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDPD1Q8N9F7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDPD1Q8N9F7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDPD1Q8N9F7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDPD1Q8N9F7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDPD1Q8N9F7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDPD1Q8N9F7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDPD1Q8N9F7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDPD1Q8N9F7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GDPD1Q8N9F7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDPD1Q8N9F7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDPD1Q8N9F7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDPD1Q8N9F7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDPD1Q8N9F7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDPD1Q8N9F7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDPD1Q8N9F7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDPD1Q8N9F7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDPD1Q8N9F7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDPD1Q8N9F7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDPD1Q8N9F7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GDPD1Q8N9F7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GDPD1Q8N9F7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GDPD1Q8N9F7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GDPD1Q8N9F7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDPD1Q8N9F7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDPD1Q8N9F7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDPD1Q8N9F7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDPD1Q8N9F7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDPD1Q8N9F7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDPD1Q8N9F7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDPD1Q8N9F7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDPD1Q8N9F7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDPD1Q8N9F7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDPD1Q8N9F7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDPD1Q8N9F7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GDPD1Q8N9F7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDPD1Q8N9F7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GDPD1Q8N9F7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDPD1Q8N9F7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDPD1Q8N9F7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GDPD1Q8N9F7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GDPD1Q8N9F7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDPD1Q8N9F7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GDPD1Q8N9F7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GDPD1Q8N9F7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GDPD1Q8N9F7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GDPD1Q8N9F7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GDPD1Q8N9F7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GDPD1Q8N9F7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GDPD1Q8N9F7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDPD1Q8N9F7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GDPD1Q8N9F7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GDPD1Q8N9F7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GDPD1Q8N9F7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GDPD1Q8N9F7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GDPD1Q8N9F7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GDPD1Q8N9F7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDPD1Q8N9F7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDPD1Q8N9F7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GDPD1Q8N9F7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GDPD1Q8N9F7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms