Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CFAP73A6NFT4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms